Opis projektu
Podejście in silico do dysekcji struktur błonowych
Synteza lipidów zachodzi głównie w retikulum endoplazmatycznym, a gotowe cząsteczki są transportowane do błon komórkowych organelli przez pęcherzyki. Najnowsze dane pokazują, że transport lipidów pomiędzy organellami może odbywać się również bez udziału pęcherzyków szlakami wykorzystującymi białka transportujące lipidy. Ten proces dodatkowo umożliwia komórkom zmianę składu lipidowego ich błon komórkowych w zależności od warunków jakie panują w środowisku. Badacze z finansowanego ze środków UE projektu MCS-MD chcą opisać strukturę miejsc kontaktu błon organelli (ang. membrane contact sites, MCS), gdzie zachodzi transport lipidów. Badacze scharakteryzują białka MCS oraz mechanizm, przy pomocy którego pomagają one w transporcie lipidów, a także w innych procesach.
Cel
The goal of this project is to obtain an atomistic structural and dynamical characterization of the inner workings of membrane contact sites (MCS) between intracellular organelles, in order to understand how molecular processes such as non-vesicular lipid transport at MCS might modulate lipid homeostatic processes at the whole-cell scale.
Investigation of the mechanisms taking place at MCS has emerged as a central topic in cellular biology in the last few years, and it has led to a large amount of novel cellular, biochemical and structural data that has drastically revolutionized our general understanding of lipid homeostasis in the cell. Yet, due to limitations of experimental methods, a high-resolution understanding of how MCS proteins work is still limited, and the specific molecular details of these mechanisms are still under intense debate, and especially concerning the specificity of lipid transport or the discrimination between lipid sensing and lipid transport.
To understand these processes with unprecedented molecular detail, I will develop high-throughput protocols based on atomistic and coarse-grain molecular dynamics simulations that leverage and take advantage of all the available, yet often scattered, experimental data. With these approaches, that have not been used so far to investigate MCS because of the extreme complexity of these cellular machineries, I will obtain a detailed understanding of key molecular processes taking place at MCS, including the specificity of membrane binding, the mechanism of lipid uptake and release, the influence of confinement on protein activity, and the role of membrane lipid composition in the regulation of lipid transport.
This approach will drive forward our perception of the limits of structure-based in-silico methods, and it will contribute to our mechanistic understanding of key cellular biology processes by providing new quantitative results that are beyond the current possibilities of experimental approaches.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki społeczne socjologia problemy społeczne nierówności społeczne
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna fizjologia homeostaza
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
ERC-STG - Starting Grant
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2018-STG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
1700 Fribourg
Szwajcaria
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.