Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Controllability of biological networks

Opis projektu

Nowe metody kontroli sieci biologicznych

Elementy biologiczne łączą się ze sobą, tworząc sieci. Możliwość kontrolowania ich dynamiki jest kluczowa dla badań naukowych, szczególnie w przemyśle farmaceutycznym i medycznym. Pomimo postępu w badaniach nad sieciami biologicznymi, odpowiednie metody obliczeniowe jeszcze nie powstały. Projekt NETCONTROLOGY zgłębi sposoby kontroli sieci biologicznych, skupiając się na dwóch nowoczesnych zagadnieniach medycznych: przeprogramowaniu sieci nowotworowych (znalezienie słabych punktów, na które można oddziaływać lekiem, co wspomoże terapię nowotworową) oraz koncentracji na źródłach enzymów antyoksydacyjnych, aby wspierać neuroprotekcję podczas udaru mózgu. W tym celu w ramach projektu powstaną nieliniowe, ilościowe i dynamiczne modele sieci biologicznych z licznymi mechanizmami regulacyjnymi. Opracowane zostaną także różne metody porównywania sieci na podstawie możliwości ich kontroli.

Cel

A dynamic system is controllable if, given suitable inputs, it can be driven from any initial state to any desired final state in finite time. Despite the advances in network science, computational approaches that can be used to characterize the dynamics of complex, biological systems are still lacking. This project aims at determining how biological networks can be controlled with focus on two cutting-edge case studies from medicine. Existing controllability approaches work essentially on graphs and do not consider other constraints typically arising in biological systems (e.g. steady-state). This strengthens the need for development of such methods. In this project, nonlinear, quantitative and dynamic network models will be developed for biological networks with multiple regulatory mechanisms. In these networks, it is vital to identify the subset of key components and regulatory interactions whose perturbation leads to the desirable functional changes. However, it is typically neither feasible, nor necessary to control the whole network. Instead, for many practical applications, it would suffice to control a preselected subsystem of target nodes. Besides full controllability, target controllability of the networks will also be addressed. Different measures will be developed to compare networks based on their controllability. The established network control principles will be exploited to (a) reprogram cancer networks through their druggable vulnerabilities to improve anticancer therapeutics (case study 1), and (b) target the enzymatic sources of relevant oxidative stress to support neuroprotection in stroke (case study 2).

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2018

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

UNIVERSITEIT MAASTRICHT
Wkład UE netto
€ 253 052,16
Adres
MINDERBROEDERSBERG 4
6200 MD Maastricht
Niderlandy
Region
Zuid-Nederland Limburg (NL) Zuid-Limburg
Rodzaj działalności
Higher or Secondary Education Establishments
Linki
Koszt całkowity
€ 253 052,16

Partnerzy (1)