Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Characterization of the circadian chromatin landscape using a novel CRISPR/Cas9-guided proximity-labelling technique

Opis projektu

Mapowanie biologicznego zegara organizmu

Większość organizmów żywych dysponuje zegarem biologicznym, który jest zsynchronizowany z porami roku lub cyklem dnia i nocy. Prawidłowe funkcjonowanie tych 24-godzinnych (dobowych) cykli ma ogromne znaczenie dla ludzi, a ich stałe zaburzanie skutkuje poważnymi chorobami. Rzeczywisty proces stojący za rytmem dobowym nie został w pełni poznany. Projekt CLOCK planuje zastosowanie wykorzystującej biblioteki CRISPR/Cas9-APEX metody znakowania CASPEX na potrzeby mapowania trzech najważniejszych obszarów regulujących rytm dobowy, a także znalezienie nowych czynników modyfikujących zegar biologiczny. Oczekuje się, że wyniki projektu pozwolą lepiej zrozumieć, problem podczas leczenia często występujących w UE chorób związanych z zaburzeniami rytmu dobowego, takich jak nowotwory, cukrzyca oraz choroby układu sercowo-naczyniowego i choroby neurodegeneracyjne.

Cel

To stay in synchrony with environmental cycles, most living organisms possess endogenous clocks. Circadian clocks are molecular oscillators present in most mammalian cells that drive circadian (~24 h) rhythms of a wide range of molecular, physiological and behavioral functions. Circadian clocks are essential for health. In humans their dysregulation (e.g. caused by shift work, jet lag etc.) has been associated with the development of multiple pathologies (e.g. cancer, metabolic diseases like diabetes and obesity as well as cardiovascular and neurodegenerative diseases) prevalent in the European Union.

One central aspect of molecular oscillator function is the tight regulation of circadian transcription. Over the years, several proteins and cis-regulatory enhancer elements (i.e. specific sequences located around the promoter region, e.g. E-box, RRE, D-box) have been shown to be essential for circadian transcription. However, mainly because of technical limitations, those studies focused on few regulators and have left many gaps in the understanding of the dynamics of the circadian transcription. Therefore, this project proposes to use state-of-the-art quantitative genomic-locus proteomics to provide the first comprehensive and unbiased characterization of the rhythmic protein binding at key circadian regulatory regions – a key regulatory node of circadian clock function Using a CRISPR/Cas9-APEX labelling method (CASPEX), we will first characterize the circadian chromatin landscape of the three main circadian regulatory regions (i.e. E-boxes, RREs, D-boxes). We expect to find new clock modifiers, whose role for circadian rhythm generation will be investigated in a subsequent part of the project, using an RNAi-based secondary screen. Overall, this project will provide novel insights in the circadian oscillator mechanism in humans, which is essential for developing better treatment strategies for circadian clock-associated disorders.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2018

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

CHARITE - UNIVERSITAETSMEDIZIN BERLIN
Wkład UE netto
€ 162 806,40
Koszt całkowity
€ 162 806,40