Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Three-dimensional dynamic views of proteomes as a novel readout for physiological and pathological alterations

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Mechanism of connexin channel inhibition by mefloquine and 2-aminoethoxydiphenyl borate (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Pia Lavriha, Yufei Han, Xinyue Ding, Dina Schuster, Chao Qi, Anand Vaithia, Paola Picotti, Volodymyr M. Korkhov
Opublikowane w: PLOS ONE, Numer 19, 2024, Strona(/y) e0315510, ISSN 1932-6203
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0315510

Systematic detection of functional proteoform groups from bottom-up proteomic datasets (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Bludau, Isabell Frank, Max Dörig, Christian Cai, Yujia Heusel, Moritz Rosenberger, George Picotti, Paola Collins, Ben C. Röst, Hannes Aebersold, Ruedi
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 20411723, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24030-x

An approach to characterize mechanisms of action of anti-amyloidogenic compounds in vitro and in situ (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: P. Stalder, T. Serdiuk, D. Ghosh, Y. Fleischmann, N. Ait-Bouziad, J.-P. Quast, L. Malinovska, A. Ouared, A. Davranche, W. Haenseler, C. Boudou, E. Tsika, J. Stöhr, R. Melki, R. Riek, N. de Souza, P. Picotti
Opublikowane w: npj Parkinson's Disease, Numer 11, 2025, ISSN 2373-8057
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41531-025-00966-5

Molecular and functional landscape of malignant serous effusions for precision oncology (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Rebekka Wegmann, Lorenz Bankel, Yasmin Festl, Kate Lau, Sohyon Lee, Fabian Arnold, Valentina Cappelletti, Aaron Fehr, Paola Picotti, Konstantin J. Dedes, Daniel Franzen, Daniela Lenggenhager, Peter K. Bode, Martin Zoche, Holger Moch, Christian Britschgi, Berend Snijder
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-52694-8

Comparative analysis of the intracellular responses to disease-related aggregation-prone proteins (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Melnik, Andre Cappelletti, Valentina Vaggi, Federico Piazza, Ilaria Tognetti, Marco Schwarz, Carmen Cereghetti, Gea Ahmed, Mennat A. Soste, Martin Matlack, Kent de Souza, Natalie Csikasz-Nagy, Attila Picotti, Paola
Opublikowane w: Journal of Proteomics, Numer 18743919, 2020, ISSN 1874-3919
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jprot.2020.103862

USP16 counteracts mono-ubiquitination of RPS27a and promotes maturation of the 40S ribosomal subunit (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Montellese, Christian van den Heuvel, Jasmin Ashiono, Caroline Dörner, Kerstin Melnik, André Jonas, Stefanie Zemp, Ivo Picotti, Paola Gillet, Ludovic C. Kutay, Ulrike
Opublikowane w: eLife, Numer 2050084X, 2020, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.54435

Analysis of Limited Proteolysis-Coupled Mass Spectrometry Data (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Luise Nagel, Jan Grossbach, Valentina Cappelletti, Christian Dörig, Paola Picotti, Andreas Beyer
Opublikowane w: Molecular & Cellular Proteomics, Numer 24, 2025, Strona(/y) 100934, ISSN 1535-9476
Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.mcpro.2025.100934

Global profiling of protein complex dynamics with an experimental library of protein interaction markers (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Christian Dörig, Cathy Marulli, Thomas Peskett, Norbert Volkmar, Lorenzo Pantolini, Gabriel Studer, Camilla Paleari, Fabian Frommelt, Torsten Schwede, Natalie de Souza, Yves Barral, Paola Picotti
Opublikowane w: Nature Biotechnology, 2024, ISSN 1087-0156
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-024-02432-8

Combining data integration and molecular dynamics for target identification in α-Synuclein-aggregating neurodegenerative diseases: Structural insights on Synaptojanin-1 (Synj1). (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Kirsten Jenkins; Teodora Mateeva; István Szabó; Andre Melnik; Paola Picotti; Attila Csikász-Nagy; Attila Csikász-Nagy; Edina Rosta
Opublikowane w: Computational and Structural Biotechnology Journal, Vol 18, Iss , Pp 1032-1042 (2020), Numer 20010370, 2020, ISSN 2001-0370
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.3929/ethz-b-000465810

Comparative analysis of cancer cell responses to targeted radionuclide therapy (TRT) and external beam radiotherapy (EBRT) (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Grzmil, Michal Boersema, Paul Sharma, Ashish Blanc, Alain Imobersteg, Stefan Pruschy, Martin Picotti, Paola Schibli, Roger Behe, Martin
Opublikowane w: Journal of Hematology & Oncology, Numer 17568722, 2022, ISSN 1756-8722
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13045-022-01343-y

Combining CRISPRi and metabolomics for functional annotation of compound libraries (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Miquel Anglada-Girotto; Gabriel Handschin; Karin Ortmayr; Adrian I. Campos; Ludovic Gillet; Pablo Manfredi; Claire V. Mulholland; Michael Berney; Urs Jenal; Paola Picotti; Mattia Zampieri
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, 18 (5), Numer 15524469, 2022, ISSN 1552-4469
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41589-022-00970-3

Dynamic 3D proteomes reveal protein functional alterations at high resolution in situ (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Valentina Cappelletti, Thomas Hauser, Ilaria Piazza, Monika Pepelnjak, Liliana Malinovska, Tobias Fuhrer, Yaozong Li, Christian Dörig, Paul Boersema, Ludovic Gillet, Jan Grossbach, Aurelien Dugourd, Julio Saez-Rodriguez, Andreas Beyer, Nicola Zamboni, Amedeo Caflisch, Natalie de Souza, Paola Picotti
Opublikowane w: Cell, Numer 184/2, 2021, Strona(/y) 545-559.e22, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2020.12.021

Systematic detection of functional proteoform groups from bottom-up proteomic datasets (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Isabell Bludau; Isabell Bludau; Max Frank; Christian Dörig; Yujia Cai; Moritz Heusel; Moritz Heusel; George Rosenberger; George Rosenberger; Paola Picotti; Ben C. Collins; Ben C. Collins; Hannes L. Röst; Ruedi Aebersold; Ruedi Aebersold
Opublikowane w: Nature Communications, 12 (1), Numer 5, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.3929/ethz-b-000491987

Detecting Protein-Small Molecule Interactions Using Limited Proteolysis-Mass Spectrometry (LiP-MS). (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Monika Pepelnjak; Natalie de Souza; Natalie de Souza; Paola Picotti
Opublikowane w: Trends in Biochemical Sciences, Numer 3, 2020, ISSN 0968-0004
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.3929/ethz-b-000441347

A machine learning-based chemoproteomic approach to identify drug targets and binding sites in complex proteomes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ilaria Piazza, Nigel Beaton, Roland Bruderer, Thomas Knobloch, Crystel Barbisan, Lucie Chandat, Alexander Sudau, Isabella Siepe, Oliver Rinner, Natalie de Souza, Paola Picotti, Lukas Reiter
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-18071-x

Global, in situ analysis of the structural proteome in individuals with Parkinson’s disease to identify a new class of biomarker (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Mackmull, Marie-Therese Nagel, Luise Sesterhenn, Fabian Muntel, Jan Grossbach, Jan Stalder, Patrick Bruderer, Roland Reiter, Lukas van de Berg, Wilma D.J. de Souza, Natalie Beyer, Andreas Picotti, Paola
Opublikowane w: Nature Structural & Molecular Biology, Numer 14764687, 2022, ISSN 1476-4687
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41594-022-00837-0

Pyruvate kinase variant of fission yeast tunes carbon metabolism, cell regulation, growth and stress resistance (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Kamrad, Stephan Grossbach, Jan Rodríguez-López, Maria Mülleder, Michael Townsend, StJohn Cappelletti, Valentina Stojanovski, Gorjan Correia-Melo, Clara Picotti, Paola Beyer, Andreas Ralser, Markus Bähler, Jürg
Opublikowane w: Molecular Systems Biology, Numer 17444292, 2020, ISSN 1744-4292
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.20199270

Deciphering the signaling network of breast cancer improves drug sensitivity prediction. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Marco Tognetti; Attila Gábor; Attila Gábor; Mi Yang; Mi Yang; Valentina Cappelletti; Jonas Windhager; Oscar M. Rueda; Konstantina Charmpi; Elham Esmaeilishirazifard; Elham Esmaeilishirazifard; Alejandra Bruna; Natalie de Souza; Natalie de Souza; Carlos Caldas; Carlos Caldas; Andreas Beyer; Paola Picotti; Julio Saez-Rodriguez; Julio Saez-Rodriguez; Bernd Bodenmiller
Opublikowane w: Cell Systems, 12 (5), Numer 24054720, 2021, ISSN 2405-4720
Wydawca: CellPress
DOI: 10.3929/ethz-b-000485506

Structure of Mycobacterium tuberculosis Cya, an evolutionary ancestor of the mammalian membrane adenylyl cyclases (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Mehta, Ved Khanppnavar, Basavraj Schuster, Dina Kantarci, Ilayda Vercellino, Irene Kosturanova, Angela Iype, Tarun Stefanic, Sasa Picotti, Paola Korkhov, Volodymyr M.
Opublikowane w: eLife, Numer 2050084X, 2022, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.77032

In situ analysis of osmolyte mechanisms of proteome thermal stabilization (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Monika Pepelnjak, Britta Velten, Nicolas Näpflin, Tatjana von Rosen, Umberto Capasso Palmiero, Jeong Hoon Ko, Heather D. Maynard, Paolo Arosio, Eilika Weber-Ban, Natalie de Souza, Wolfgang Huber, Paola Picotti
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, Numer 20, 2024, Strona(/y) 1053-1065, ISSN 1552-4450
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-024-01568-7

Reversible amyloids of pyruvate kinase couple cell metabolism and stress granule disassembly (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Gea Cereghetti, Caroline Wilson-Zbinden, Vera M. Kissling, Maren Diether, Alexandra Arm, Haneul Yoo, Ilaria Piazza, Shady Saad, Paola Picotti, D. Allan Drummond, Uwe Sauer, Reinhard Dechant, Matthias Peter
Opublikowane w: Nature Cell Biology, Numer 23/10, 2021, Strona(/y) 1085-1094, ISSN 1465-7392
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-021-00760-4

Limited Proteolysis-Mass Spectrometry to Identify Metabolite-Protein Interactions

Autorzy: Aleš Holfeld, Jan-Philipp Quast, Roland Bruderer, Lukas Reiter, Natalie de Souza & Paola Picotti
Opublikowane w: Cell-Wide Identification of Metabolite-Protein Interactions, 2022, ISBN 978-1-0716-2624-5
Wydawca: Springer Nature

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Podczas wyszukiwania danych OpenAIRE wystąpił błąd

Brak wyników

Moja broszura 0 0