Opis projektu
Organoidalna platforma tkanek ludzkich w ramach inicjatywy Human Cell Atlas
Projekt Human Cell Atlas to globalna inicjatywa naukowa, której celem jest odwzorowanie i scharakteryzowanie wszystkich komórek ludzkiego ciała według ich rodzaju, liczby, lokalizacji, wzajemnych stosunków i struktury molekularnej. Uznawana jest ona za podstawowe przyszłe źródło informacji dla naukowców umożliwiające zrozumienie, jak działają zdrowe komórki i co dzieje się w przypadku choroby. Podczas finansowanego ze środków UE projektu HCA Organoid w ramach inicjatywy Human Cell Atlas zostanie stworzony atlas ludzkich organoidów (Human Organoid Atlas) w celu zwiększenia możliwości wyciągania wniosków funkcjonalnych/przyczynowych/mechanistycznych istotnych w kontekście ludzkich chorób. W ramach projektu powstaną transkryptomy jednokomórkowe, epigenomy jednokomórkowe oraz dane obrazowe dla kilku tysięcy organoidów i odpowiadającej im tkanki pierwotnej. Początkowo prace skupią się na okrężnicy i mózgu, a dodatkowe narządy zostaną włączone do projektu w ramach badań pilotażowych. Ogólnie rzecz biorąc, zasoby te umożliwią charakteryzowanie typowych wahań populacji i będą stanowić punkt odniesienia na potrzeby badań nad chorobami.
Cel
"Excellence: The Human Cell Atlas (HCA) is descriptive by definition, as it seeks to map all cells in the human body. Yet its goal of “understanding fundamental human biological processes and diagnosing, monitoring, and treating disease” (HCA Whitepaper) depends on our ability to draw functional/causal/mechanistic conclusions relevant to human diseases. Personalized organoid technology aptly fills this gap, as it makes human tissue amenable to functional studies and faithful disease modeling in vitro.
This project will firmly establish a ""Human Organoid Atlas"" within the HCA. Initially focusing on two organs (colon and brain: 100 distinct organoid lines each). We will establish single-cell transcriptomes, single-cell epigenomes, and time-series imaging for several thousand organoids and matched primary tissue. This resource will primarily quantify normal population variation and provide a baseline for disease studies. Moreover, the project will include data generation and analysis of >20 colorectal cancer organoid lines with matching organoid lines derived from normal (healthy) material as well as the respective matching primary tissue. We will show the practical utility of the resource by proof-of-concept disease modeling for genetic epilepsy (brain) and large-scale characterization of disease-linked genetic variants (colon).
Impact: 1. Deeply characterized organoid collection enables functional and disease-centric studies pursuing HCA insights. 2. Single-cell dataset provides reference of population variation under highly standardized conditions. 3. Linking single-cell profiling and organoids will boost HCA’s impact on human health.
Implementation: The project connects the European founders of organoid research (Hans Clevers, Jürgen Knoblich) with expertise in large-scale epigenome/transcriptome profiling (Christoph Bock, Henk Stunnenberg), advanced imaging (Prisca Liberali, Anne Rios), bioinformatics and systems genetics (Oliver Stegle, Michael Boutros), data management (Laura Clarke/EBI), and strong SME contribution (Hubrecht Organoid Technology, Eurice). The project is fully committed to the HCA's values. It implements extensive data sharing and sustainability measures."
Dziedzina nauki
Słowa kluczowe
Program(-y)
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSzczegółowe działanie
H2020-SC1-2019-Single-Stage-RTD
System finansowania
RIA - Research and Innovation actionKoordynator
1090 Wien
Austria