Opis projektu
Badanie czynników potencjalnie warunkujących różnorodność genetyczną
Różnorodność genetyczna odgrywa zasadniczą rolę w adaptowaniu się organizmów do zmian środowiska oraz odporności ekosystemu. Jednak nasza wiedza na temat czynników warunkujących różnorodność genetyczną pozostaje ograniczona, choć naukowcy wyliczają potencjalne uwarunkowania, takie jak wielkość populacji, mutacje, selekcja, tempo specjacji, rekombinacja, historia życia oraz cechy ekologiczne. Badacze z finansowanego ze środków UE projektu DIFFER proponują zastosowanie zaawansowanych technik z dziedziny genomiki w połączeniu z niezwykle użytecznym systemem modelowym w celu zbadania roli wszystkich wymienionych powyżej potencjalnych czynników warunkujących różnorodność genetyczną. Projekt będzie się koncentrować na ponad 200 gatunkach endemicznych ryb z rodzaju pielęgnicowatych żyjących w jeziorze Tanganika w Afryce Wschodniej, które dzięki swoim wyjątkowym cechom stanowią idealną bazę do analiz porównawczych.
Cel
Genetic diversity – that is, the genomic variation among individuals of a given species – is pivotal for adaptation to environmental alterations and an important factor for ecosystem resilience. Yet, the determinants of genetic diversity remain poorly understood. Population size is often used as a proxy for genetic diversity, but the amount of genetic variation within populations is not always reflected by their population size. Instead, factors such as linked selection, the recombination-, mutation-, and speciation rate, or life history and ecological traits may be more strongly connected to genetic diversity. So far, the interplay of all these parameters has not been empirically investigated, so that their relative contributions to genetic diversity are unknown.
In DIFFER!, I propose to thoroughly examine the role of all these potential determinants of genetic diversity by means of combining cutting-edge genomic techniques with a highly suitable model system: the more than 200 endemic cichlid fish species of the East African Lake Tanganyika. Owing to their great morphological and behavioral variation, contrasting speciation rates, and their recent radiation, these fishes offer an ideal framework for comparative analyses. Availability of long-read reference assemblies, recombination maps, a massive dataset of underwater photographs for estimating census population sizes, together with population sequencing of selected species and family-based ‘trio’ sequencing will enable me to investigate specifically the interplay between genetic diversity and (i) life history and ecological traits, (ii) speciation and hybridization rates, and (iii) mutation rates, while at the same time controlling for variation in population size, selection, and recombination.
The results of this project will contribute towards the understanding of organismal evolution and provide a new basis for the evaluation of genetic diversity in ecosystem management.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykamutacja
- nauki społecznesocjologiademografiaspis powszechny
- nauki przyrodniczenauki biologiczneekologiaekosystemy
- nauki przyrodniczenauki biologicznezoologiaichtiologia
- inżynieria i technologiainżynieria śodowiskagospodarka oparta na ekosystemie
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Koordynator
4051 Basel
Szwajcaria