Opis projektu
Nowatorska metoda sekwencjonowania białek
Modyfikacje potranslacyjne zapewniają białkom szerokie funkcjonalne zróżnicowanie, co ma zasadnicze znaczenie dla żywych organizmów. Jednak wykrycie tych modyfikacji poprzez sekwencjonowanie lub spektrometrię mas podlega pewnym ograniczeniom. Obie techniki są pracochłonne, wymagają przygotowania szerokiego zakresu próbek, nie uwzględniają białek o niskiej liczebności ani nie dostarczają informacji na poziomie pojedynczych komórek. W ramach finansowanego przez UE projektu SMPSBN naukowcy proponują opracowanie metody podobnej do sekwencjonowania nanoporów DNA w celu określenia modyfikacji potranslacyjnych w wysokosprawny sposób z wykorzystaniem zdolności do wykrywania pojedynczych cząsteczek. Przewiduje się, że po realizacji projektu technologia ta zrewolucjonizuje badania proteomiczne i utoruje drogę do ich wykorzystania klinicznego.
Cel
Despite the importance of post-translational variation to the function of proteins in a living organism, sequencing proteins to study these variations is still a costly and time-consuming process, with intrinsic limitations. Protein sequencing and detection of post-translational modifications (PTMs) by mass spectrometry, the current gold standard, requires extensive sample preparation and large sample sizes, and possesses a limited dynamic range with respect to sample concentration. These limitations severely restrict its application to biological and clinical problems. A robust method for sequencing proteins and detecting PTMs at the single-molecule level would be revolutionary for proteomics research, allowing biologists to quantify low-abundance proteins as well as distributions and correlations of PTM patterns, all at a single-cell level. I propose a first-of-kind method for protein sequencing with applications in fundamental biology, cancer immunotherapy, and pharmaceutical development. This method uses biological nanopores in a manner similar to nanopore DNA sequencing, an established single-molecule sequencing technology capable of high throughput and single-molecule sensitivity. Developing this method for protein sequencing comes with many significant challenges, which will be addressed over the course of the proposed research.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiochemiabiocząsteczkibiałkaproteomika
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykaDNA
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznaonkologia
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznaimmunologiaimmunoterapia
- nauki przyrodniczenauki chemicznechemia analitycznaspektrometria mas
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF-EF-ST - Standard EFKoordynator
2628 CN Delft
Niderlandy