Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Single molecule protein sequencing using biological nanopores

Opis projektu

Nowatorska metoda sekwencjonowania białek

Modyfikacje potranslacyjne zapewniają białkom szerokie funkcjonalne zróżnicowanie, co ma zasadnicze znaczenie dla żywych organizmów. Jednak wykrycie tych modyfikacji poprzez sekwencjonowanie lub spektrometrię mas podlega pewnym ograniczeniom. Obie techniki są pracochłonne, wymagają przygotowania szerokiego zakresu próbek, nie uwzględniają białek o niskiej liczebności ani nie dostarczają informacji na poziomie pojedynczych komórek. W ramach finansowanego przez UE projektu SMPSBN naukowcy proponują opracowanie metody podobnej do sekwencjonowania nanoporów DNA w celu określenia modyfikacji potranslacyjnych w wysokosprawny sposób z wykorzystaniem zdolności do wykrywania pojedynczych cząsteczek. Przewiduje się, że po realizacji projektu technologia ta zrewolucjonizuje badania proteomiczne i utoruje drogę do ich wykorzystania klinicznego.

Cel

Despite the importance of post-translational variation to the function of proteins in a living organism, sequencing proteins to study these variations is still a costly and time-consuming process, with intrinsic limitations. Protein sequencing and detection of post-translational modifications (PTMs) by mass spectrometry, the current gold standard, requires extensive sample preparation and large sample sizes, and possesses a limited dynamic range with respect to sample concentration. These limitations severely restrict its application to biological and clinical problems. A robust method for sequencing proteins and detecting PTMs at the single-molecule level would be revolutionary for proteomics research, allowing biologists to quantify low-abundance proteins as well as distributions and correlations of PTM patterns, all at a single-cell level. I propose a first-of-kind method for protein sequencing with applications in fundamental biology, cancer immunotherapy, and pharmaceutical development. This method uses biological nanopores in a manner similar to nanopore DNA sequencing, an established single-molecule sequencing technology capable of high throughput and single-molecule sensitivity. Developing this method for protein sequencing comes with many significant challenges, which will be addressed over the course of the proposed research.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2019

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

TECHNISCHE UNIVERSITEIT DELFT
Wkład UE netto
€ 187 572,48
Koszt całkowity
€ 187 572,48