A computational framework to interpret the chemical language of the microbiome

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

MIBiG 3.0: a community-driven effort to annotate experimentally validated biosynthetic gene clusters

Autorzy: Terlouw BR, Blin K, Navarro-Muñoz JC, Avalon NE, Chevrette MG, Egbert S, Lee S, Meijer D, Recchia MJJ, Reitz ZL, van Santen JA, Selem-Mojica N, Tørring T, Zaroubi L, Alanjary M, Aleti G, Aguilar C, Al-Salihi SAA, Augustijn HE, Avelar-Rivas JA, Avitia-Domínguez LA, Barona-Gómez F, Bernaldo-Agüero J, Bielinski VA, Biermann F, Booth TJ, Carrion Bravo VJ, Castelo-Branco R, Chagas FO, Cruz-Morales
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, 2023, Strona(/y) D603-D610, ISSN 1362-4962
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac1049

gutSMASH predicts specialized primary metabolic pathways from the human gut microbiota

Autorzy: Victòria Pascal Andreu; Hannah E. Augustijn; Lianmin Chen; Alexandra Zhernakova; Jingyuan Fu; Michael A. Fischbach; Dylan Dodd; Marnix H. Medema
Opublikowane w: ISSN=10870156;TITLE=Nature Biotechnology, Numer 1, 2023, ISSN 1546-1696
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41587-023-01675-1

The antiSMASH database version 4: additional genomes and BGCs, new sequence-based searches and more

Autorzy: Kai Blin; Simon Shaw; Marnix H Medema; Tilmann Weber
Opublikowane w: Crossref, Numer 2, 2023, Strona(/y) 0305-1048, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad984

The gutSMASH web server: automated identification of primary metabolic gene clusters from the gut microbiota.

Autorzy: Victòria Pascal Andreu; Jorge Roel-Touris; Dylan Dodd; Michael A. Fischbach; Marnix H. Medema
Opublikowane w: urn:issn:03051048, Numer 1, 2021, ISSN 1362-4962
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab353

improving cluster detection and comparison capabilities

Autorzy: Kai Blin; Simon Shaw; Alexander M. Kloosterman; Zach Charlop-Powers; Gilles P. van Wezel; Marnix H. Medema; Marnix H. Medema; Tilmann Weber
Opublikowane w: TITLE=Nucleic Acids Research, Numer 1, 2021, Strona(/y) W29-W35, ISSN 1362-4962
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab335

Genome mining strategies for metallophore discovery.

Autorzy: Zachary L Reitz; Marnix H Medema
Opublikowane w: urn:issn:09581669, Numer 1, 2022, Strona(/y) 102757, ISSN 1879-0429
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.copbio.2022.102757

antiSMASH 7.0: new and improved predictions for detection, regulation, chemical structures and visualisation

Autorzy: Blin K, Shaw S, Augustijn HE, Reitz ZL, Biermann F, Alanjary M, Fetter A, Terlouw BR, Metcalf WW, Helfrich EJN, van Wezel GP, Medema MH, Weber T
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, 2023, Strona(/y) W46-W50, ISSN 1362-4962
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad344

Compendium of specialized metabolite biosynthetic diversity encoded in bacterial genomes

Autorzy: Athina Gavriilidou; Satria A. Kautsar; Nestor Zaburannyi; Daniel Krug; Rolf Müller; Marnix H. Medema; Nadine Ziemert
Opublikowane w: ISSN: 2058-5276, Numer 1, 2022, ISSN 2058-5276
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41564-022-01110-2

CAGECAT: The CompArative GEne Cluster Analysis Toolbox for rapid search and visualisation of homologous gene clusters

Autorzy: Matthias van den Belt; Cameron Gilchrist; Thomas J. Booth; Yit-Heng Chooi; Marnix H. Medema; Mohammad Alanjary
Opublikowane w: ISSN: 1471-2105, Numer 2, 2023, Strona(/y) 181, ISSN 1471-2105
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-023-05311-2

Artificial intelligence for natural product drug discovery

Autorzy: Mullowney MW, Duncan KR, Elsayed SS, Garg N, van der Hooft JJJ, Martin NI, Meijer D, Terlouw BR, Biermann F, Blin K, Durairaj J, Gorostiola González M, Helfrich EJN, Huber F, Leopold-Messer S, Rajan K, de Rond T, van Santen JA, Sorokina M, Balunas MJ, Beniddir MA, van Bergeijk DA, Carroll LM, Clark CM, Clevert DA, Dejong CA, Du C, Ferrinho S, Grisoni F, Hofstetter A, Jespers W, Kalinina OV, Kauts
Opublikowane w: Nature Reviews Drug Discovery, 2023, ISSN 1474-1776
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41573-023-00774-7

Automated genome mining predicts combinatorial diversity and taxonomic distribution of peptide metallophore structures

Autorzy: Reitz ZL, Butler A, Medema MH
Opublikowane w: BioRxiv, 2022
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2022.12.14.519525

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Publikacje

Udostępnij tę stronę Udostępnij tę stronę w mediach społecznościowych

Pobierz Pobierz zawartość strony