Odkrywanie sieci cząsteczkowej limfocytów T
Limfocyty Th to komórki o kluczowej roli w odporności adaptacyjnej. Rozpoznają one obce antygeny i różnicują się w odmienne podzbiory w odpowiedzi na różne patogeny. Jednak regulacja cząsteczkowa tego różnicowania pozostaje nie w pełni rozumiana. Istniejące raporty opierają się na transkryptomice konwencjonalnej bazującej na populacjach komórek. Wygenerowane dane reprezentują jednak wartości średnie uzyskane na podstawie dużej liczby komórek, nie wyjaśniając odmiennych typów komórek w obrębie populacji. Aby przezwyciężyć to ograniczenie, zespół finansowanego przez UE projektu "The molecular regulation of T helper cell subtype plasticity" (THPLAST) przystąpił do badania dynamiki systemu odpornościowego, a zwłaszcza procesu różnicowania limfocytów Th na poziomie pojedynczej komórki. Naukowcy wykorzystali model myszy, który zapewnia reakcję odpornościową typu 2 w następstwie infekcji u robaka z gatunku N. brasiliensis. Badacze wyizolowali pojedyncze limfocyty Th CD4+ z różnych tkanek mysich i poddali je analizie ekspresji genów. Na początek ustalili, że ich metoda była czuła, zakres występowania błędu dopuszczalny, a także istniała dobra ogólna współzależność między poziomami mRNA a białka. Następnie dokonali pomiaru poziomów ekspresji 96 różnych genów w naiwnych, jak i aktywowanych limfocytach T. Aktywowane limfocyty T wykazywały wyższe poziomy genów związanych z odpornością Th2 oraz z regulacyjnymi limfocytami T. W oparciu o ekspresję genów profil komórek można było skategoryzować w trzy różne populacje, a mianowicie regulacyjne limfocyty T, folikulinowe limfocyty Th oraz inne wcześniej niezidentyfikowane podzbiory. Ta ostatnia populacja komórek wykazywała ekspresję jądrowego receptora RORA hormonu i prawdopodobnie odpowiadała za wyzwolenie sekrecji cytokiny i aktywację komórek. Komórki dodatnie RORA były głównie zlokalizowane w tkankach obwodowych, takich jak płucne i jelitowe, co podkreśla ich znaczenie w miejscowych reakcjach odpornościowych. Podsumowując, odkrycia zespołu THPLAST przyczyniają się do pełniejszego zrozumienia sieci regulacyjnej zaangażowanej w rozwój limfocytów Th. Jednym z głównych odkryć badania było zidentyfikowanie komórek o dziedzicznej plastyczności, które przejawiają zdolność do różnicowania w odrębne podzbiory komórek w odpowiedzi na sygnały zewnętrzne.
Słowa kluczowe
Limfocyty Th, odporność adaptacyjna, regulacja cząsteczkowa, plastyczność, różnicowanie komórek
