Hubner popiera fundusze regionalne, wykorzystujac powiazania miedzy celami strategii lizbonskiej a celami polityki spojnosci
Komisarz UE ds. Polityki Regionalnej, Danuta Hübner, przyrównała cele strategii lizbońskiej do priorytetów finansowych polityki spójności. Wykorzystała również te podobieństwa, apelując do instytucji unijnych, aby jak najszybciej osiągnęły one porozumienie w sprawie finansowych perspektyw UE, w których znalazłyby się fundusze odpowiednie do sfinansowania tych wspólnych celów. W latach 2000-2006, w ramach funduszy strukturalnych i innych instrumentów przeznaczono około 265 miliardów euro na inwestycje na rzecz wsparcia najuboższych regionów UE i obszarów dotkniętych problemami strukturalnymi - kwota ta stanowi jednš trzeciš budżetu unijnego. W swoim ostatnim raporcie Duński Instytut Technologiczny zbadał podobieństwa między strategiš lizbońskš a priorytetami finansowymi polityki spójno�ci. Okazało się, że ponad 50 procent inwestycji w ramach funduszy strukturalnych - jednego z głównych elementów polityki spójno�ci - przeznaczona jest na inicjatywy "typu lizbońskiego". Także przyznanie "rezerwy wykonania" (performance reserve) stanowi dowód na to, że fundusze strukturalne w dużym stopniu przeznacza się na badania i innowacje oraz �wiadczy o powodzeniu takich inicjatyw. Rezerwę wykonania wprowadzono na okres programowania obejmujący lata 2000-2006. Stanowi ona cztery procent środków przydzielonych każdemu Państwu Członkowskiemu, odłożonych do rezerwy na ustalony okres, w którym przeznacza się je dla najlepszych programów krajowych. W trzecim sprawozdaniu dotyczącym postępów polityki spójności Komisja stwierdza, że: "Wiele Państw Członkowskich wykorzystało rezerwę wykonania w celu zwiększenia wsparcia gospodarki opartej na wiedzy poprzez nawiązanie współpracy między instytutami badawczymi i przedsiębiorstwami, rozwój ugrupowań gospodarczych i ośrodków badawczych, inwestycje w szerokopasmowy dostęp do Internetu, opracowywanie regionalnych strategii inwestycyjnych oraz szkolenie naukowców, a także projekty dotyczące badań stosowanych". W niektórych krajach rezerwę wykonania wykorzystano do wsparcia przedsiębiorczości, przyznając dotacje nowym oraz małym i innowacyjnym przedsiębiorstwom. Podej�cie to jest zgodne z życzeniami głów państw i rzšdów UE, którzy w marcu 2005 r. nawoływali między innymi podmioty regionalne i lokalne do zwiększenia zaangażowania w strategię lizbońskš oraz aktywnego uczestnictwa w realizacji celu lizbońskiego polegajšcego na uczynieniu z Europy najbardziej konkurencyjnej gospodarki na �wiecie do roku 2010. Podczas wiosennych obrad Rady Europejskiej podkre�lono również potrzebę stworzenia "biegunów innowacji" oraz partnerstw na szczeblu regionalnym i lokalnym; nawoływano także do redystrybucji pomocy państwa na korzy�ć niektórych celów horyzontalnych, takich jak badania, innowacje oraz integracyjne społeczeństwo informacyjne.