Czego może nas nauczyć bakteria żyjąca w temperaturach poniżej zera?
We wszystkich klimatach i ekosystemach rośliny współżyją z różnymi mikroorganizmami. Mimo że mikrobiolodzy zidentyfikowali społeczności arktycznych bakterii, które przystosowują się do niskich temperatur, brak jest wystarczających informacji na temat różnorodności mikroorganizmów żyjących w klimatach zimnych w odniesieniu do endofitycznych bakterii roślin arktycznych. Niedostatek wiedzy w tym zakresie jest znaczący, biorąc pod uwagę fakt, że mikroorganizmy arktyczne mogą znaleźć zastosowanie w zrównoważonym rolnictwie, przemyśle i farmacji. Pożyteczne cechy bakterii endofitycznych, zamieszkujących wewnętrzne tkanki roślin, obejmują mobilizację składników odżywczych, pobudzanie wzrostu, detoksykację i biokontrolę patogenów roślin. W nawiązaniu do tych zagadnień, celem projektu "Różnorodność i pożyteczne właściwości endofitycznych bakterii roślin arktycznych" (Arctic endophytes) było zbadanie różnorodności bakterii endofitycznych w roślinach arktycznych. Finansowany ze środków UE zespół badawczy zajmował się także analizą cech bakterii endofitycznych w odniesieniu do ich potencjalnego znaczenia dla ekologii i zastosowań praktycznych. Partnerzy projektu scharakteryzowali taksonomię i różnorodność funkcjonalną flory endobakteryjnej trzech gatunków roślin arktyczno-alpejskich występujących w północno-zachodniej Skandynawii. Wyizolowano florę endobakteryjną z próbek roślin zebranych z trzech miejsc i przeanalizowano różnorodność endofitów oraz funkcjonalną różnorodność nadających się do hodowli endobakterii. Zastosowano różne techniki, w tym hodowlę, metody oparte na DNA i badania aktywności. Analizy ponad 350 wyizolowanych bakterii endofitycznych i inne badania ujawniły dużą różnorodność bakterii żyjących w asocjacji z badanymi roślinami. Odkryto różne grupy bakterii, które są blisko powiązane z konkretnymi gatunkami roślin i prawdopodobnie praktycznie w ogólnie nieobecne w innych roślinach. Odkryto także, że szczep bakterii Sphigomonas sp. wykazuje różne profile metaboliczne w zależności od danych roślin-gospodarzy. Projekt "Arctic endophytes" to pierwsze kompleksowe badanie dotyczące różnorodności endobakteryjnej Arktyki. W oparciu o wyniki projektu naukowcy będą kontynuowali swoje prace i rozszerzą zakres badań.
