Opis projektu
Na ile jesteśmy w stanie przewidzieć adaptację zbieżną?
Pomimo postępu teoretycznego w dziedzinie biologii ewolucyjnej, nadal nie wiemy wystarczająco dużo o konwergencji w przypadku złożonych organizmów wielokomórkowych. Wiedza ta pomaga tymczasem w zrozumieniu różnorodnych zjawisk, takich jak odporność na patogeny, pestycydy czy zanieczyszczenia. Zespół finansowanego przez UE projektu CONstrainCONverge bada ewolucyjne mechanizmy przewidywalności w ewolucji adaptacyjnej. Dzięki połączeniu genomiki ewolucyjnej i genetyki molekularnej, transkryptomiki, genomiki statystycznej i eksperymentów funkcjonalnych, badania te mają rzucić światło na genetyczne ograniczenia adaptacji zbieżnej do stresujących środowisk. Modelem roślinnym, który zostanie wykorzystany jest alpejski rzodkiewnik, ponieważ jego osiem populacji, które wyewoluowały niezależnie od siebie, stanowi idealne źródło do eksperymentów.
Cel
Is evolution predictable? In CONstrainCONverge, I aim to understand evolutionary mechanisms governing predictability in adaptive evolution, by asking why some genes are more likely reused by adaptation than others. Despite a rich theoretical background, systematic analysis of the mechanisms underlying convergence is lacking in complex multicellular organisms. That limits application of convergent evolutionary concepts in repeated evolution of socio-economically relevant traits such as resistance to pathogens, pesticides or pollution. To fill in this gap, I will study genetic constraints of convergent adaptation towards stressful alpine environments in plant model genus Arabidopsis. Eight independently evolved populations of alpine Arabidopsis provide a unique model of environmental adaptation, allowing to leverage an unprecedented range of genetic and experimental resources to address fundamental evolutionary questions. During my PhD I characterized this system from a population genomic point of view, preparing a ground for experimental genetic validations. In the outgoing phase, I will bring this experience to the host lab of Prof. Peichel at the University of Bern (UBERN), an expert in the evolutionary genetics of convergence in fishes. Systematic training in the host lab and three international research visits will broaden my bioinformatics and experimental skills. I will learn new multidisciplinary approaches bridging the fields of evolutionary genomics and molecular genetics through the combination of transcriptomics, statistical genomics, and functional experiments. I will return to Charles University (CU) to share the newly gained skills with local researchers and gain further training in functional genetics and transferable skills under the supervision of Prof. Lafon Placette, aiming to improve my teaching and leadership skills and establish my own research group in evolutionary genetics, a virtually non-existent field in Czech research environment.
Dziedzina nauki
Słowa kluczowe
Program(-y)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSystem finansowania
HORIZON-TMA-MSCA-PF-GF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - Global FellowshipsKoordynator
116 36 Praha 1
Czechy