Opis projektu
Demokratyzacja sekwencjonowania nowej generacji dzięki nowej strukturze obliczeniowej
Sekwencjonowanie nowej generacji stało się dla medycyny i biologii tym, czym tranzystory były dla układów elektronicznych i możliwości obliczeniowych. Liczba sekwencjonowanych próbek kwasów nukleinowych co 2 lata ulega podwojeniu. Chociaż przepustowość zwiększyła się niesamowicie, przygotowywanie bibliotek sekwencji niespecjalnie doczekało się postępów, a ograniczone metody, które je umożliwiają, są kosztowne i czasochłonne. Projekt MultiSeq finansowany przez ERBN będzie pracować nad rozwiązaniem bioinformatycznym, które posłuży do przezwyciężenia tych problemów i demokratyzacji NGS. Wspomniane rozwiązanie obejmuje strategię multipleksowania w celu zmniejszenia liczby bibliotek, a następnie demultipleksowanie obliczeniowe. Algorytmy zostaną włączone w ramy obliczeniowe i poddane pilotażowi w środowisku branżowym. Zbadane zostaną również wymagania dotyczące komercjalizacji.
Cel
Recent advances in Next-Generation Sequencing (NGS) of nucleic acids (i.e. DNA or RNA) have transformed biology and medicine. Today NGS is one of the main pillars of research in various biological disciplines, and it has already pervaded numerous fields of applications ranging from clinics to the biotechnological industry. Given its versatility and high demand, the global market for NGS is rapidly expanding, with the number of sequenced samples doubling every two years. However, while major advances in NGS were mainly related to a rapid increase in sequencing throughput per machine, the preparation of sequencing libraries - the other
integral step of NGS, has largely remained unchanged. Currently, this step is the major financial and operational bottleneck for sequencing projects, limiting the widespread adoption and utility of NGS. Current state-of-the-art solutions for overcoming these problems either require high upfront costs and/or are laborious. We are developing a bioinformatics solution to these problems, which minimizes the cost and time of library preparation. Our approach, called MultiSeq, allows designing a multiplexing strategy to reduce the number of libraries followed by computational demultiplexing. We plan to extend the experimental proof of concept of our method by applying it to broadly sequenced species. In addition, we will integrate our algorithms into a versatile computing framework and develop a pilot project in an industrially relevant context. In parallel, we will perform market analysis and evaluate the most suitable IP protection and commercialization strategies of our technology. If successful, MultiSeq will be a game-changing approach that will impact sequencing technology and related industries by further democratizing the field of NGS and benefiting both the scientific community and society.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2023-POC
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
08034 BARCELONA
Hiszpania
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.