Opis projektu
Badanie heterogeniczności genomowej nowotworów
Komórki nowotworowe charakteryzują się wysoką częstotliwością mutacji i rearanżacji chromosomów, które prowadzą do ich różnorodności genetycznej i heterogeniczności. Aktualne dowody naukowe sugerują, że złożone rearanżacje genomowe (CGR) mogą sprzyjać ewolucji gruczolakoraka przewodowego trzustki (PDAC), najczęstszej i najbardziej śmiertelnej postaci raka trzustki. Finansowany przez program działań „Maria Skłodowska-Curie” projekt EVO-PDAC ma na celu wyjaśnienie roli CGR, wariantów strukturalnych i mutacji punktowych w progresji PDAC. Przy pomocy najnowocześniejszych technik naukowcy stworzą atlasy multiomiczne PDAC na różnych etapach. Wyniki tych prac pomogą badaczom zrozumieć ewolucję PDAC i pojawienie się heterogeniczności wewnątrz guza.
Cel
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is the most common type of pancreatic cancer, a disease with a dismal prognosis. PDAC has an especially high tendency of quickly metastasizing and becoming resistant to therapy, and the mechanisms by which this occurs are largely unknown. Recent evidence suggests that saltatory or burst-like evolution mediated by complex genomic rearrangements (CGRs) may be especially relevant in PDAC, altering multiple cancer genes in a single event. However, quantifying CGRs requires specialized techniques (such as Strand-Seq), and therefore the relative importance of CGRs, simple structural variants, and point mutations in PDAC evolution remains unclear. In this project, we will use a genetically engineered mouse model (GEMM) that develops de novo PDAC to longitudinally track PDAC evolution by single-cell and spatial multi-omic methods, using Strand-Seq to accurately detect CGRs. Thus, we aim to create longitudinal single-cell and spatial multi-omic atlases of PDAC at three key evolutionary steps: pre-cancer, therapy-naive PDAC, and post-therapy PDAC. In addition, we will compare our atlases to human PDAC data from the Spatial And Temporal Resolution of Intratumoral Heterogeneity in 3 hard-to-treat Cancers (SATURN3) Consortium. In this way, we will model PDAC evolution at various time points, quantifying the relative importance of gradual vs saltatory evolution and determining how evolvability changes over time. Moreover, we will infer the role of selective pressures from the tumor microenvironment (e.g. immune cells and cancer-associated fibroblasts) in shaping PDAC evolution. Finally, we will explore how all these factors interact with the high intratumoral heterogeneity observed in PDAC. Overall, this project will answer long-standing questions about the evolutionary dynamics of PDAC.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznaonkologiarak prostaty
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykamutacja
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSystem finansowania
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsKoordynator
69117 Heidelberg
Niemcy