Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Cracking the code of amyloid polymorphism: Integrating cryoEM and machine learning to unravel impact of small aggregation modulators on amyloid fibril polymorphism

Opis projektu

Kod polimorfizmu amyloidu w przebiegu chorób neurodegeneracyjnych

Choroby neurodegeneracyjne, w tym choroby Alzheimera i Parkinsona, stanowią poważne zagrożenia dla zdrowia, a ich przyczyną jest nieprawidłowe fałdowanie białek i gromadzenie amyloidów. Wciąż jednak nie przebadaliśmy kompleksowo znaczenia polimorfizmu strukturalnego. Zespół finansowanego ze środków Unii Europejskiej projektu AMI-CryoML zbada modulatory agregacji amyloidu oraz ich wpływ na kinetykę agregacji i polimorfizm. Celem prac jest zebranie i przeanalizowanie danych na temat znanych modulatorów, ze szczególnym uwzględnieniem ich właściwości chemicznych i mechanizmów działania. W ramach projektu badacze przeanalizują sposób, w jaki modulatory wpływają na różne fazy agregacji amyloidów, przy użyciu testów ThT, a także ocenią ich skuteczność w odniesieniu do różnych amyloidów, w tym prionów, CsgA i α-synukleiny. W projekcie badacze wykorzystają kriomikroskopię elektronową do badania polimorfizmów strukturalnych, opracują bazę danych AmyloGraph, a także wykorzystają algorytmy uczenia maszynowego do opracowania modeli predykcyjnych.

Cel

Neurodegenerative diseases such as Alzheimer's (AD), Parkinson’s (PD), and prion-related disorders pose major global health challenges due to their progressive nature and lack of effective treatments. Central to these conditions is the misfolding and aggregation of proteins into amyloid structures, which cause severe cellular damage. Despite advances in understanding amyloid aggregation, the role of structural polymorphism in these processes remains underexplored. This proposal aims to address this gap by investigating amyloid aggregation modulators and their effects on aggregation kinetics and polymorphism.

The project has five main objectives:
1. Data Collection on agregation modulators: Systematically gather and curate data on known modulators that impact amyloid aggregation, focusing on their chemical properties and mechanisms.
2. Aggregation kinetics studies: Study the impact of selected modulators on the kinetics of amyloid self-aggregation using ThT assays. This includes analyzing how modulators influence different phases of aggregation and testing their efficacy on a range of amyloids, including prions, CsgA, and α-synuclein.
3. Study structural polymorphisms via CryoEM: Utilize Cryo-Electron Microscopy (CryoEM) to resolve and map the structural polymorphs of amyloids under various conditions. Providing insights into impact of modulators on structural polymorphism and aggregation kinetics.
4. AmyloGraph database enhancement: Develop a new module for the AmyloGraph database to store and analyze data on modulators, aggregation kinetics, and structural polymorphisms.
5. Development of ML models: Leverage machine learning to develop predictive and generative models to forecast amyloid aggregation kinetics and modulator effects, incorporating structural polymorphisms, and generate new modulators targeting specific polymorphic forms.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-WIDERA-2024-TALENTS-02

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

VILNIAUS UNIVERSITETAS
Wkład UE netto
€ 181 136,16
Koszt całkowity
Brak danych