Cel
The dramatic success of infectious agents comes from their ability to adapt to both immune and pharmaceutical selective pressures. To uncover the dynamics of bacterial adaptation, experimental evolution has been widely used, focusing mostly on organismal fitness. Many of the observation derived from these experiments have been captured by Fisher's Geometric model of Adaptation (FGMA). Despite its success, this top-down phenotypic model is relatively abstract. In fact, its most important parameter, the number of independent phenotypes an organism expose to the action of natural selection, or phenotypic complexity, remains completely disconnected from a genetic perspective. More recently, bottom-up genotype to phenotype maps from system biology have provided an alternative to unravel the constraints regulating bacterial evolution.
In the present project, I want to connect these different approaches. The interpretation of system biology models in terms of FGMA will (i) uncover the genetic determinants of phenotypic complexity, giving more genetic context to FGMA, and, (ii) transpose our understanding of evolution through FGMA to complex genotype to phenotype maps.
Four different levels of integration will be used: the gene, the metabolic network, the organism and the species. I will use
-antibiotic resistance gene, TEM1, to connect thermodynamic models of protein evolution to FGMA, and characterize the phenotypic complexity of a single gene,
-computational models of metabolic network and experimental modification of a biochemical pathway regulation to assess the meaning of phenotypic complexity in networks,
-in vitro and in vivo experimental evolution coupled with genome sequencing and mutant reconstruction to assess the molecular bases of changes in beneficial mutation rates during organismal adaptation,
- faeces of well characterised human twins to assess the factors of the human gut's environment that shape the genetic diversity of the Escherichia coli species.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne termodynamika
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka mutacja
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna farmakologia i farmacja oporność na leki oporność na antybiotyki
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
ERC-2012-StG_20111109
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Instytucja przyjmująca
75654 PARIS
Francja
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.