Cracking the epitranscriptome

Informacje na temat projektu

CrackEpitranscriptom

Identyfikator umowy o grant: 714023

DOI

10.3030/714023

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 25 Października 2016

Data rozpoczęcia 1 Listopada 2016

Data zakończenia 30 Kwietnia 2022

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 402 666,00

Wkład UE

€ 1 402 666,00

Koordynowany przez

WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE
Israel

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (10)

Quantitative nucleotide resolution profiling of RNA cytidine acetylation by ac4C-seq

Autorzy: Supuni Thalalla Gamage, Aldema Sas-Chen, Schraga Schwartz, Jordan L. Meier
Opublikowane w: Nature Protocols, Numer 16/4, 2021, Strona(/y) 2286-2307, ISSN 1754-2189
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41596-021-00501-9

Multiplexed profiling facilitates robust m6A quantification at site, gene and sample resolution.

Autorzy: David Dierks, Miguel Angel Garcia-Campos, Anna Uzonyi, Modi Safra, Sarit Edelheit, Alice Rossi, Theodora Sideri, Radhika A. Varier, Alexander Brandis, Yonatan Stelzer, Folkert van Werven, Ruth Scherz-Shouval & Schraga Schwartz
Opublikowane w: Nature Methods, 2021, ISSN 1548-7105
Wydawca: Nature Methods
DOI: 10.1038/s41592-021-01242-z

The m1A landscape on cytosolic and mitochondrial mRNA at single-base resolution

Autorzy: Modi Safra, Aldema Sas-Chen, Ronit Nir, Roni Winkler, Aharon Nachshon, Dan Bar-Yaacov, Matthias Erlacher, Walter Rossmanith, Noam Stern-Ginossar, Schraga Schwartz
Opublikowane w: Nature, 2017, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature24456

TRUB1 is the predominant pseudouridine synthase acting on mammalian mRNA via a predictable and conserved code

Autorzy: Modi Safra, Ronit Nir, Daneyal Farouq, Ilya Vainberg Slutskin, Schraga Schwartz
Opublikowane w: Genome Research, Numer 27/3, 2017, Strona(/y) 393-406, ISSN 1088-9051
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.207613.116

Variants in PUS7 Cause Intellectual Disability with Speech Delay, Microcephaly, Short Stature, and Aggressive Behavior

Autorzy: Arjan P.M. de Brouwer, Rami Abou Jamra, Nadine Körtel, Clara Soyris, Daniel L. Polla, Modi Safra, Avia Zisso, Christopher A. Powell, Pedro Rebelo-Guiomar, Nadja Dinges, Violeta Morin, Michael Stock, Mureed Hussain, Mohsin Shahzad, Saima Riazuddin, Zubair M. Ahmed, Rolph Pfundt, Franziska Schwarz, Lonneke de Boer, André Reis, Detilina Grozeva, F. Lucy Raymond, Sheikh Riazuddin, David A. Koolen, M
Opublikowane w: The American Journal of Human Genetics, Numer 103/6, 2018, Strona(/y) 1045-1052, ISSN 0002-9297
Wydawca: University of Chicago Press
DOI: 10.1016/j.ajhg.2018.10.026

m6A modification controls the innate immune response to infection by targeting type I interferons

Autorzy: Roni Winkler, Ella Gillis, Lior Lasman, Modi Safra, Shay Geula, Clara Soyris, Aharon Nachshon, Julie Tai-Schmiedel, Nehemya Friedman, Vu Thuy Khanh Le-Trilling, Mirko Trilling, Michal Mandelboim, Jacob H. Hanna, Schraga Schwartz, Noam Stern-Ginossar
Opublikowane w: Nature Immunology, Numer 20/2, 2019, Strona(/y) 173-182, ISSN 1529-2908
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41590-018-0275-z

Context-dependent functional compensation between Ythdf m6A reader proteins

Autorzy: Lior Lasman, Vladislav Krupalnik, Shay Geula, Mirie Zerbib, Sergey Viukov, Nofar Mor, Alejandro Aguilera Castrejon, Orel Mizrahi, Sathe Shashank, Aharon Nachshon, Dan Schneir, Stefan Aigner, Archana Shankar, Jasmine Mueller, Noam Stern-Ginossar, Gene W Yeo, Noa Novershtern, Jacob H Hanna
Opublikowane w: Genes and Development, Numer Vol.34 (19-20), 2020, Strona(/y) 1373-1391, ISSN 0890-9369
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/2020.06.03.131441

Dynamic RNA acetylation revealed by quantitative cross-evolutionary mapping

Autorzy: Aldema Sas-Chen, Justin M. Thomas, Donna Matzov, Masato Taoka, Kellie D. Nance, Ronit Nir, Keri M. Bryson, Ran Shachar, Geraldy L. S. Liman, Brett W. Burkhart, Supuni Thalalla Gamage, Yuko Nobe, Chloe A. Briney, Michaella J. Levy, Ryan T. Fuchs, G. Brett Robb, Jesse Hartmann, Sunny Sharma, Qishan Lin, Laurence Florens, Michael P. Washburn, Toshiaki Isobe, Thomas J. Santangelo, Moran Shalev-Benami,
Opublikowane w: Nature, Numer 583/7817, 2020, Strona(/y) 638-643, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2418-2

Deciphering the “m6A Code” via Antibody-Independent Quantitative Profiling

Autorzy: Miguel Angel Garcia-Campos, Sarit Edelheit, Ursula Toth, Modi Safra, Ran Shachar, Sergey Viukov, Roni Winkler, Ronit Nir, Lior Lasman, Alexander Brandis, Jacob H. Hanna, Walter Rossmanith, Schraga Schwartz
Opublikowane w: Cell, Numer 178/3, 2019, Strona(/y) 731-747.e16, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.06.013

m 1 A within cytoplasmic mRNAs at single nucleotide resolution: a reconciled transcriptome-wide map

Autorzy: Schraga Schwartz
Opublikowane w: RNA, Numer 24/11, 2018, Strona(/y) 1427-1436, ISSN 1355-8382
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1261/rna.067348.118