Single-Molecule And Structural Studies Of ATP-Dependent Chromatin Remodelling

Informacje na temat projektu

ChromatinRemodelling

Identyfikator umowy o grant: 714068

DOI

10.3030/714068

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 19 Października 2016

Data rozpoczęcia 1 Marca 2017

Data zakończenia 31 Sierpnia 2022

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 498 954,00

Wkład UE

€ 1 498 954,00

Koordynowany przez

UPPSALA UNIVERSITET
Sweden

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (12)

Structure and dynamics of the chromatin remodeler ALC1 bound to a PARylated nucleosome

Autorzy: Luka Bacic; Guillaume Gaullier; Anton Sabantsev; Laura C. Lehmann; Klaus Brackmann; Despoina Dimakou; Mario Halic; Graeme Hewitt; Simon J. Boulton; Sebastian Deindl
Opublikowane w: eLife, Numer 2, 2021, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.71420

Spatiotemporally controlled generation of NTPs for single-molecule studies

Autorzy: Anton Sabantsev, Guanzhong Mao, Javier Aguirre Rivera, Mikhail Panfilov, Anatolii Arseniev, Oanh Ho, Mikhail Khodorkovskiy & Sebastian Deindl
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, Numer 15524469, 2022, ISSN 1552-4469
Wydawca: Nature
DOI: 10.1038/s41589-022-01100-9

Defective ALC1 nucleosome remodeling confers PARPi sensitization and synthetic lethality with HRD

Autorzy: Graeme Hewitt, Valerie Borel, Sandra Segura-Bayona, Tohru Takaki, Phil Ruis, Roberto Bellelli, Laura C. Lehmann, Lucia Sommerova, Aleksandra Vancevska, Antonia Tomas-Loba, Kang Zhu, Christopher Cooper, Kasper Fugger, Harshil Patel, Robert Goldstone, Deborah Schneider-Luftman, Ellie Herbert, Gordon Stamp, Rachel Brough, Stephen Pettitt, Christopher J. Lord, Stephen C. West, Ivan Ahel, Dragana Ahel,
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 81/4, 2021, Strona(/y) 767-783.e11, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.12.006

Mechanistic Insights into Regulation of the ALC1 Remodeler by the Nucleosome Acidic Patch

Autorzy: Laura C. Lehmann, Luka Bacic, Graeme Hewitt, Klaus Brackmann, Anton Sabantsev, Guillaume Gaullier, Sofia Pytharopoulou, Gianluca Degliesposti, Hanneke Okkenhaug, Song Tan, Alessandro Costa, J. Mark Skehel, Simon J. Boulton, Sebastian Deindl
Opublikowane w: Cell Reports, Numer 33/12, 2020, Strona(/y) 108529, ISSN 2211-1247
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2020.108529

Structure-guided approach to site-specific fluorophore labeling of the lac repressor LacI

Autorzy: Kalle Kipper, Nadja Eremina, Emil Marklund, Sumera Tubasum, Guanzhong Mao, Laura Christina Lehmann, Johan Elf, Sebastian Deindl
Opublikowane w: PLOS ONE, Numer 13/6, 2018, Strona(/y) e0198416, ISSN 1932-6203
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0198416

New enzymatic and mass spectrometric methodology for the selective investigation of gut microbiota-derived metabolites

Autorzy: Caroline Ballet, Mário S. P. Correia, Louis P. Conway, Theresa L. Locher, Laura C. Lehmann, Neeraj Garg, Miroslav Vujasinovic, Sebastian Deindl, J.-Matthias Löhr, Daniel Globisch
Opublikowane w: Chemical Science, Numer 9/29, 2018, Strona(/y) 6233-6239, ISSN 2041-6520
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c8sc01502c

Mechanistic Insights into Autoinhibition of the Oncogenic Chromatin Remodeler ALC1

Autorzy: Laura C. Lehmann, Graeme Hewitt, Shintaro Aibara, Alexander Leitner, Emil Marklund, Sarah L. Maslen, Varun Maturi, Yang Chen, David van der Spoel, J. Mark Skehel, Aristidis Moustakas, Simon J. Boulton, Sebastian Deindl
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 68/5, 2017, Strona(/y) 847-859.e7, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2017.10.017

Direct observation of coordinated DNA movements on the nucleosome during chromatin remodelling

Autorzy: Anton Sabantsev, Robert F. Levendosky, Xiaowei Zhuang, Gregory D. Bowman, Sebastian Deindl
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-09657-1

The ribosomal protein S1-dependent standby site in tisB mRNA consists of a single-stranded region and a 5′ structure element

Autorzy: Cédric Romilly, Sebastian Deindl, E. Gerhart H. Wagner
Opublikowane w: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numer 116/32, 2019, Strona(/y) 15901-15906, ISSN 0027-8424
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1904309116

Sequence specificity in DNA binding is mainly governed by association

Autorzy: E. Marklund, G. Mao, J. Yan, S. Zikrin, E. Abdurakhmanov, S. Deindl, J. Elf
Opublikowane w: Science, Numer Vol 375, Numer 6579, 2022, Strona(/y) 442-445, ISSN 1095-9203
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.abg7427

DNA surface exploration and operator bypassing during target search

Autorzy: Emil Marklund, Brad van Oosten, Guanzhong Mao, Elias Amselem, Kalle Kipper, Anton Sabantsev, Andrew Emmerich, Daniel Globisch, Xuan Zheng, Laura C. Lehmann, Otto G. Berg, Magnus Johansson, Johan Elf, Sebastian Deindl
Opublikowane w: Nature, Numer 583/7818, 2020, Strona(/y) 858-861, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2413-7

Recent advances in single-molecule fluorescence microscopy render structural biology dynamic

Autorzy: Luka Bacic, Anton Sabantsev, Sebastian Deindl
Opublikowane w: Current Opinion in Structural Biology, Numer 65, 2020, Strona(/y) 61-68, ISSN 0959-440X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2020.05.006

Non-peer reviewed articles (1)

Remodeling the genome with DNA twists

Autorzy: GREGORY D. BOWMAN AND SEBASTIAN DEINDL
Opublikowane w: Science, Numer 10959203, 2019, Strona(/y) 35-36, ISSN 1095-9203
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aay4317