An integrated mulTidisciplinary appRoach towards a new generAtIon of aNtibiotics: Targeting function and cross-talk of bacterial Envelope proTein machineries

Informacje na temat projektu

Train2Target

Identyfikator umowy o grant: 721484

DOI

10.3030/721484

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 31 Sierpnia 2016

Data rozpoczęcia 1 Stycznia 2017

Data zakończenia 31 Grudnia 2020

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Koszt całkowity

€ 3 931 378,20

Wkład UE

€ 3 931 378,20

Koordynowany przez

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI MILANO
Italy

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Documents, reports (1)

Scientific publications

Min. 45 publications in peer-reviewed journals

Other (2)

Industry course
SB and SAB established

Websites, patent fillings, videos etc. (2)

Website

Website www.train2target.eu

Science Slams

Publikacje

Peer reviewed articles (27)

Effective approaches to discover new microbial metabolites in a large strain library.

Autorzy: Mitja M Zdouc, Marianna Iorio, Kristiina Vind, Matteo Simone, Stefania Serina, Cristina Brunati, Paolo Monciardini, Arianna Tocchetti, Guadalupe S Zarazúa, Max Crüsemann, Sonia I Maffioli, Margherita Sosio, Stefano Donadio
Opublikowane w: Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, 2021, ISSN 1476-5535
Wydawca: Springer-Nature
DOI: 10.1093/jimb/kuab017

The active repertoire of Escherichia coli peptidoglycan amidases varies with physiochemical environment

Autorzy: Mueller, Elizabeth A; Iken, Abbygail G; Öztürk, Mehmet; Winkle, Matthias; Schmitz, Mirko; Vollmer, Waldemar; Di Ventura, Barbara; Levin, Petra Anne
Opublikowane w: Molecular Microbiology, 2021, ISSN 0950-382X
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mmi.14711

Carbohydrate-based adjuvants

Autorzy: Pilar Garcia-Vello, Immacolata Speciale, Fabrizio Chiodo, Antonio Molinaro, Cristina De Castro
Opublikowane w: Drug Discovery Today: Technologies, Numer 35-36, 2020, Strona(/y) 57-68, ISSN 1740-6749
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ddtec.2020.09.005

A biaryl-linked tripeptide from Planomonospora reveals a widespread class of minimal RiPP gene clusters

Autorzy: Mitja M. Zdouc, Mohammad M. Alanjary, Guadalupe S. Zarazúa, Sonia I. Maffioli, Max Crüsemann, Marnix H. Medema, Stefano Donadio, Margherita Sosio
Opublikowane w: Cell Chemical Biology, 2020, ISSN 2451-9456
Wydawca: Cell Chemical Biology
DOI: 10.1016/j.chembiol.2020.11.009

"Detection of in vivo Protein Interactions in All Bacterial Components by Förster Resonance Energy Transfer with the Superfolder mTurquoise2 ox-mNeongreen FRET Pair"

Autorzy: Nils Meiresonne, Elisa Consoli, Laureen Mertens, Tanneke den Blaauwen
Opublikowane w: BIO-PROTOCOL, Numer 9/23, 2019, ISSN 2331-8325
Wydawca: Bio-protocol
DOI: 10.21769/bioprotoc.3448

Lipoproteins in Gram-negative bacteria: new insights into their biogenesis, subcellular targeting and functional roles

Autorzy: Jessica El Rayes, Raquel Rodríguez-Alonso, Jean-François Collet
Opublikowane w: Current Opinion in Microbiology, Numer 61, 2021, Strona(/y) 25-34, ISSN 1369-5274
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.mib.2021.02.003

Structural features and immunological perception of the cell surface glycans of Lactobacillus plantarum: a novel rhamnose-rich polysaccharide and teichoic acids

Autorzy: Pilar Garcia-Vello, Garima Sharma, Immacolata Speciale, Antonio Molinaro, Sin-Hyeog Im, Cristina De Castro
Opublikowane w: Carbohydrate Polymers, Numer 233, 2020, Strona(/y) 115857, ISSN 0144-8617
Wydawca: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.carbpol.2020.115857

The Lpt ABC transporter for lipopolysaccharide export to the cell surface

Autorzy: Paola Sperandeo, Alessandra M. Martorana, Alessandra Polissi
Opublikowane w: Research in Microbiology, Numer 170/8, 2019, Strona(/y) 366-373, ISSN 0923-2508
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.resmic.2019.07.005

Planomonospora : A Metabolomics Perspective on an Underexplored Actinobacteria Genus

Autorzy: Mitja M. Zdouc, Marianna Iorio, Sonia I. Maffioli, Max Crüsemann, Stefano Donadio, Margherita Sosio
Opublikowane w: Journal of Natural Products, Numer 84/2, 2021, Strona(/y) 204-219, ISSN 0163-3864
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jnatprod.0c00807

In vitro activity of rifabutin against 293 contemporary carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii clinical isolates and characterization of rifabutin mode of action and resistance mechanisms

Autorzy: Vincent Trebosc, Birgit Schellhorn, Julian Schill, Valentina Lucchini, Jacqueline Bühler, Marilyne Bourotte, Jonathan J Butcher, Marc Gitzinger, Sergio Lociuro, Christian Kemmer, Glenn E Dale
Opublikowane w: Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Numer 75/12, 2020, Strona(/y) 3552-3562, ISSN 0305-7453
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jac/dkaa370

The cell cycle regulator GpsB functions as cytosolic adaptor for multiple cell wall enzymes

Autorzy: Robert M. Cleverley, Zoe J. Rutter, Jeanine Rismondo, Federico Corona, Ho-Ching Tiffany Tsui, Fuad A. Alatawi, Richard A. Daniel, Sven Halbedel, Orietta Massidda, Malcolm E. Winkler, Richard J. Lewis
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-018-08056-2

Thanatin Impairs Lipopolysaccharide Transport Complex Assembly by Targeting LptC–LptA Interaction and Decreasing LptA Stability

Autorzy: Elisabete C. C. M. Moura, Tiago Baeta, Alessandra Romanelli, Cedric Laguri, Alessandra M. Martorana, Emanuela Erba, Jean-Pierre Simorre, Paola Sperandeo, Alessandra Polissi
Opublikowane w: Frontiers in Microbiology, Numer 11, 2020, ISSN 1664-302X
Wydawca: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2020.00909

ActS activates peptidoglycan amidases during outer membrane stress in Escherichia coli

Autorzy: Carlos K. Gurnani Serrano, Matthias Winkle, Alessandra M. Martorana, Jacob Biboy, Niccolo Morè, Patrick Moynihan, Manuel Banzhaf, Waldemar Vollmer, Alessandra Polissi
Opublikowane w: Molecular Microbiology, 2021, ISSN 0950-382X
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mmi.14712

The lipopolysaccharide transport (Lpt) machinery: A nonconventional transporter for lipopolysaccharide assembly at the outer membrane of Gram-negative bacteria

Autorzy: Paola Sperandeo, Alessandra M. Martorana, Alessandra Polissi
Opublikowane w: Journal of Biological Chemistry, Numer 292/44, 2017, Strona(/y) 17981-17990, ISSN 0021-9258
Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/jbc.R117.802512

Copper inhibits peptidoglycan LD-transpeptidases suppressing β-lactam resistance due to bypass of penicillin-binding proteins

Autorzy: Katharina Peters, Manuel Pazos, Zainab Edoo, Jean-Emmanuel Hugonnet, Alessandra M. Martorana, Alessandra Polissi, Michael S. VanNieuwenhze, Michel Arthur, Waldemar Vollmer
Opublikowane w: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numer 115/42, 2018, Strona(/y) 10786-10791, ISSN 0027-8424
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1809285115

Interaction of lipopolysaccharides at intermolecular sites of the periplasmic Lpt transport assembly

Autorzy: Cedric Laguri, Paola Sperandeo, Kevin Pounot, Isabel Ayala, Alba Silipo, Catherine M. Bougault, Antonio Molinaro, Alessandra Polissi, Jean-Pierre Simorre
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 7/1, 2017, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-017-10136-0

Superfolder mTurquoise2 ox optimized for the bacterial periplasm allows high efficiency in vivo FRET of cell division antibiotic targets

Autorzy: Nils Y. Meiresonne, Elisa Consoli, Laureen M. Y. Mertens, Anna Chertkova, Joachim Goedhart, Tanneke den Blaauwen
Opublikowane w: Molecular Microbiology, 2019, ISSN 0950-382X
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mmi.14206

Solid State NMR Studies of Intact Lipopolysaccharide Endotoxin

Autorzy: Cedric Laguri, Alba Silipo, Alessandra M. Martorana, Paul Schanda, Roberta Marchetti, Alessandra Polissi, Antonio Molinaro, Jean-Pierre Simorre
Opublikowane w: ACS Chemical Biology, Numer 13/8, 2018, Strona(/y) 2106-2113, ISSN 1554-8929
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.8b00271

Peptidoglycan Remodeling Enables Escherichia coli To Survive Severe Outer Membrane Assembly Defect

Autorzy: Niccolò Morè, Alessandra M. Martorana, Jacob Biboy, Christian Otten, Matthias Winkle, Carlos K. Gurnani Serrano, Alejandro Montón Silva, Lisa Atkinson, Hamish Yau, Eefjan Breukink, Tanneke den Blaauwen, Waldemar Vollmer, Alessandra Polissi
Opublikowane w: mBio, Numer 10/1, 2019, Strona(/y) e02729-18, ISSN 2150-7511
Wydawca: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.02729-18

Structural insight into the formation of lipoprotein-β-barrel complexes

Autorzy: Raquel Rodríguez-Alonso, Juliette Létoquart, Van Son Nguyen, Gwennaelle Louis, Antonio N. Calabrese, Bogdan I. Iorga, Sheena E. Radford, Seung-Hyun Cho, Han Remaut, Jean-François Collet
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, Numer 16/9, 2020, Strona(/y) 1019-1025, ISSN 1552-4450
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-020-0575-0

Structure of the O‐Antigen and the Lipid A from the Lipopolysaccharide of Fusobacterium nucleatum ATCC 51191

Autorzy: Pilar Garcia‐Vello, Flaviana Di Lorenzo, Dimitra Lamprinaki, Anna Notaro, Immacolata Speciale, Antonio Molinaro, Nathalie Juge, Cristina De Castro
Opublikowane w: ChemBioChem, Numer 22/7, 2021, Strona(/y) 1252-1260, ISSN 1439-4227
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202000751

The Escherichia coli Outer Membrane β-Barrel Assembly Machinery (BAM) Anchors the Peptidoglycan Layer by Spanning It with All Subunits

Autorzy: Elisa Consoli, Jean-François Collet, Tanneke den Blaauwen
Opublikowane w: International Journal of Molecular Sciences, Numer 22/4, 2021, Strona(/y) 1853, ISSN 1422-0067
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22041853

Blocks in the pseudouridimycin pathway unlock hidden metabolites in the Streptomyces producer strain

Autorzy: Marianna Iorio, Sahar Davatgarbenam, Stefania Serina, Paolo Criscenzo, Mitja M. Zdouc, Matteo Simone, Sonia I. Maffioli, Richard H. Ebright, Stefano Donadio, Margherita Sosio
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 11/1, 2021, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-84833-2

Dissecting Colistin Resistance Mechanisms in Extensively Drug-Resistant Acinetobacter baumannii Clinical Isolates

Autorzy: Vincent Trebosc, Sarah Gartenmann, Marcus Tötzl, Valentina Lucchini, Birgit Schellhorn, Michel Pieren, Sergio Lociuro, Marc Gitzinger, Marcel Tigges, Dirk Bumann, Christian Kemmer
Opublikowane w: mBio, Numer 10/4, 2019, ISSN 2150-7511
Wydawca: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.01083-19

MreC and MreD balance the interaction between the elongasome proteins PBP2 and RodA

Autorzy: Xiaolong Liu, Jacob Biboy, Elisa Consoli, Waldemar Vollmer, Tanneke den Blaauwen
Opublikowane w: Plos Genetics, Numer 16(12), 2020, Strona(/y) e1009276, ISSN 1553-7390
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1009276

Fat Matters for Bugs: How Lipids and Lipid Modifications Make the Difference in Bacterial Life

Autorzy: Paola Sperandeo, Alessandra Polissi, Emma De Fabiani
Opublikowane w: European Journal of Lipid Science and Technology, Numer 121/10, 2019, Strona(/y) 1900204, ISSN 1438-7697
Wydawca: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/ejlt.201900204

Mutation and Suppressor Analysis of the Essential Lipopolysaccharide Transport Protein LptA Reveals Strategies To Overcome Severe Outer Membrane Permeability Defects in Escherichia coli

Autorzy: Federica A. Falchi, Elisa A. Maccagni, Simone Puccio, Clelia Peano, Cristina De Castro, Angelo Palmigiano, Domenico Garozzo, Alessandra M. Martorana, Alessandra Polissi, Gianni Dehò, Paola Sperandeo
Opublikowane w: Journal of Bacteriology, Numer 200/2, 2018, ISSN 0021-9193
Wydawca: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jb.00487-17

Other (3)

Structure-function analyses of dual-BON domain protein DolP identifies phospholipid binding as a new mechanism for protein localisation

Autorzy: J. A. Bryant, F. C. Morris, T. J. Knowles, R. Maderbocus, E. Heinz, G. Boelter, D. Alodaini, A. Colyer, P. J. Wotherspoon, K. A. Staunton, M. Jeeves, D. F. Browning, Y. R. Sevastsyanovich, T. J. Wells, A. E. Rossiter, V. N. Bavro, P. Sridhar, D. G. Ward, Z-S. Chong, C. Icke, A. Teo, S-S. Chng, View ORCID ProfileD. I. Roper, T. Lithgow, A. F. Cunningham, M. Banzhaf, M. Overduin, I. R. Henderson
Opublikowane w: BioRxiv, 2020
Wydawca: BioRxiv
DOI: 10.1101/2020.08.10.244616

Disorder is a critical component of lipoprotein sorting in Gram-negative bacteria

Autorzy: Jessica El Rayes, Joanna Szewczyk, Michael Deghelt, André Matagne, Bogdan I. Iorga, Seung-Hyun Cho, Jean-François Collet
Opublikowane w: BioRxiv, 2021
Wydawca: BioRxiv
DOI: 10.1101/2021.01.05.425367

Metabolomic investigation of the pseudouridimycin producer, a prolific streptomycete

Autorzy: Iorio, M., Davatgarbenam, S., Serina, S., Criscenzo, P., Zdouc, M.M., Simone, M., Maffioli, S.I., Ebright, R.H., Donadio, S. and Sosio, M.
Opublikowane w: BioRxiv, Numer 5. November 2020, 2020
Wydawca: BioRxiv
DOI: 10.1101/2020.11.05.369249

Thesis and dissertations (1)

Antibiotic drug development

Autorzy: Matias, C. S. S., Sommer, M. O. A., Ingmer, H., Weber, T., Polissi, A., & Olsen, J. E.
Opublikowane w: 2020
Wydawca: Technical University of Denmark