Smart capture phases for proteomics, glycomics and biomarker assays

Informacje na temat projektu

BioCapture

Identyfikator umowy o grant: 722171

DOI

10.3030/722171

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 31 Sierpnia 2016

Data rozpoczęcia 1 Listopada 2016

Data zakończenia 31 Października 2021

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Koszt całkowity

€ 2 982 872,07

Wkład UE

€ 2 982 872,07

Koordynowany przez

MALMO UNIVERSITET
Sweden

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Documents, reports (1)

Project vacancies advertised

Websites, patent fillings, videos etc. (3)

Project website published and accessible
Produce a minimum of two press releases
Produce a project poster and a presentation

Publikacje

Peer reviewed articles (23)

Magnetic Synthetic Receptors for Selective Clean-Up in Protein Biomarker Quantification

Autorzy: Nicholas McKitterick, Frida Braathen, Magdalena A. Switnicka-Plak, Peter A. G. Cormack, Léon Reubsaet, Trine Grønhaug Halvorsen
Opublikowane w: Journal of Proteome Research, Numer 19/8, 2020, Strona(/y) 3573-3582, ISSN 1535-3893
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jproteome.0c00258

Oxoanion Imprinting Combining Cationic and Urea Binding Groups: A Potent Glyphosate Adsorber

Autorzy: Sudhirkumar Shinde, Mona Mansour, Liliia Mavliutova, Anil Incel, Celina Wierzbicka, Hussein I. Abdel-Shafy, and Börje Sellergren
Opublikowane w: ACS Omega, 2021, ISSN 2470-1343
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsomega.1c05079

Urea-based imprinted polymer hosts with switchable anion preference

Autorzy: Sudhirkumar Shinde; Sudhirkumar Shinde; Anıl İncel; Mona Mansour; Gustaf D. Olsson; Ian A. Nicholls; Cem Esen; Javier Urraca; Börje Sellergren; Börje Sellergren
Opublikowane w: Journal of the American Chemical Society, Numer 142(26), 2020, ISSN 0002-7863
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.0c00707

Improved Solvothermal Synthesis of γ-Fe2O3 Magnetic Nanoparticles for SiO2 Coating

Autorzy: Rashmi Mahajan; Subramanian Suriyanarayanan; Ian A. Nicholls
Opublikowane w: Nanomaterials, Numer 11(8), 2021, ISSN 2079-4991
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/nano11081889

Affinity capture in bottom-up protein analysis –overview of current status of proteolytic peptide capture using antibodies and molecularly imprinted polymers

Autorzy: Halvorsen TG, McKitterick N, Kish, M.; Reubsaet, L.
Opublikowane w: Anal. Chim. Acta, Numer 1182, 2021, ISSN 0003-2670
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.aca.2021.338714

The glycosylation design space for recombinant lysosomal replacement enzymes produced in CHO cells.

Autorzy: Weihua Tian, Zilu Ye, Shengjun Wang, Morten Alder Schulz, Julie Van Coillie, Lingbo Sun, Yen-Hsi Chen, Yoshiki Narimatsu, Lars Hansen, Claus Kristensen, Ulla Mandel, Eric Paul Bennett, Siamak Jabbarzadeh-Tabrizi, Raphael Schiffmann, Jin-Song Shen, Sergey Y. Vakhrushev, Henrik Clausen & Zhang Yang
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 10, 2019, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-09809-3

Strategies for Molecular Imprinting and the Evolution of MIP Nanoparticles as Plastic Antibodies—Synthesis and Applications

Autorzy: Refaat, D.; Aggour, M. G.; Farghali, A. A.; Mahajan, R.; Wiklander, J. G.; Nicholls, I. A.; Piletsky, S. A.
Opublikowane w: Int. Journal of Molecular Sciences, Numer 20(24), 2019, ISSN 1422-0067
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms20246304

Selective Enrichment of Histidine Phosphorylated Peptides Using Molecularly Imprinted Polymers

Autorzy: Anıl Incel, Ignacio Arribas Díez, Celina Wierzbicka, Katarzyna Gajoch, Ole N. Jensen, Börje Sellergren
Opublikowane w: Analytical Chemistry, 2021, ISSN 0003-2700
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.0c04474

An Atlas of Human Glycosylation Pathways Enables Display of the Human Glycome by Gene Engineered Cells

Autorzy: Narimatsu, Yoshiki; Joshi, Hiren J.; Nason, Rebecca; Van Coillie, Julie; Karlsson, Richard; Sun, Lingbo; Ye, Zilu; Chen, Yen-Hsi; Schjoldager, Katrine T.; Steentoft, Catharina; Furukawa, Sanae; Bensing, Barbara A.; Sullam, Paul M.; Thompson, Andrew J.; Paulson, James C.; Büll, Christian; Adema, Gosse J.; Mandel, Ulla; Hansen, Lars; Bennett, Eric Paul; Varki, Ajit; Vakhrushev, Sergey Y.; Yang, Zha
Opublikowane w: Mol Cell, Numer 75(2), 2019, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.05.017

Zirconium(IV)-IMAC Revisited: Improved Performance and Phosphoproteome Coverage by Magnetic Microparticles for Phosphopeptide Affinity Enrichment

Autorzy: Ignacio Arribas Diez, Ireshyn Govender, Previn Naicker, Stoyan Stoychev, Justin Jordaan, Ole N. Jensen
Opublikowane w: J. Proteome Research, Numer 20, 2021, ISSN 1535-3893
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jproteome.0c00508

The Use of Computational Methods for the Development of Molecularly Imprinted Polymers

Autorzy: Ian A. Nicholls; Kerstin Golker; Gustaf D. Olsson; Subramanian Suriyanarayanan; Jesper G. Wiklander
Opublikowane w: Polymers, Vol 13, Iss 2841, p 2841 (2021), Numer 1, 2021, ISSN 2073-4360
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/polym13172841

Exploring Regulation of Protein O-Glycosylation in Isogenic Human HEK293 Cells by Differential O-Glycoproteomics

Autorzy: Narimatsu Y, Joshi HJ, Schjoldager KT, Hintze J, Halim A, Steentoft C, Nason R, Mandel U, Bennett EP, Clausen H, Vakhrushev SY
Opublikowane w: Mol. Cell Proteomics, Numer 18(7), 2019, ISSN 1535-9476
Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/mcp.ra118.001121

High salt compatible oxyanion receptors by dual ion imprinting

Autorzy: Sudhirkumar Shinde; Mona Mansour; Anıl İncel; Liliia Mavliutova; Celina Wierzbicka; Börje Sellergren
Opublikowane w: Chemical Science, Numer 11 (16), 2020, ISSN 2041-6520
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c9sc06508c

Combinatorial design of a sialic acid imprinted binding site exploring a dual ion receptor approach

Autorzy: Liliia Mavliutova; Elena Verduci; Börje Sellergren
Opublikowane w: RSC Advances, Numer 11, 2021, Strona(/y) 34329-34337, ISSN 2046-2069
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1ra06962d

Mesoporous polymeric microspheres with high affinity for phosphorylated biomolecules

Autorzy: Sudhirkumar Shinde, Jayashree Selvalatchmanan, Anil Incel, Maedeh Akhoundian, Anne K. Bendt, Federico Torta
Opublikowane w: New Journal of Chemistry, Numer 42/11, 2018, Strona(/y) 8603-8608, ISSN 1144-0546
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/C8NJ01114A

Highly efficient synthesis and assay of protein imprinted nanogels using magnetic templates

Autorzy: Rashmi Mahajan, Mona Rouhi, Sudhirkumar Shinde, Thomas Bedwell, Anil Incel, Liliia Mavliutova, Sergey Piletsky, Ian Nicholls, Börje K-E Sellergren
Opublikowane w: Angewandte Chemie International Edition, Numer 58 (3), 2018, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201805772

Selective detection of phospholipids using molecularly imprinted fluorescent sensory core-shell particles.

Autorzy: Qianjin Li, Sudhirkumar Shinde, Giuliana Grasso, Antonio Caroli, Rahma Abouhany, Michele Lanzillotta, Guoqing Pan, Wei Wan, Knut Rurack & Börje Sellergren
Opublikowane w: Nature Scientific Report, Numer 10, 2020, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-66802-3

Facilitating serum determination of neuron specific enolase at clinically relevant levels by coupling on-line molecularly imprinted solid-phase extraction to LC-MS/MS

Autorzy: Nicholas McKitterick, Tugrul Cem Bicak, Peter A. G. Cormack, Léon Reubsaet, and Trine Grønhaug Halvorsen
Opublikowane w: Anal. Chim. Acta, Numer 1140, 2020, ISSN 0003-2670
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.aca.2020.10.022

Engineering mammalian cells to produce plant-specific N-glycosylation on proteins

Autorzy: Joachim Steen Larsen; Richard Karlsson; Weihua Tian; Morten Alder Schulz; Annemarie Matthes; Henrik Clausen; Bent Larsen Petersen; Zhang Yang
Opublikowane w: Glycobiology, Numer 1, 2020, ISSN 0959-6658
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/glycob/cwaa009

Probing the binding specificities of human Siglecs by cell-based glycan arrays

Autorzy: Christian Büll; Rebecca Nason; Lingbo Sun; Julie Van Coillie; Daniel Madriz Sørensen; Sam J. Moons; Zhang Yang; Steven Arbitman; Steve M. Fernandes; Sanae Furukawa; Ryan McBride; Corwin M. Nycholat; Gosse J. Adema; James C. Paulson; Ronald L. Schnaar; Thomas J. Boltje; Henrik Clausen; Yoshiki Narimatsu
Opublikowane w: Proc Natl Acad Sci U S A, Numer 118(17), 2021, ISSN 0027-8424
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2026102118

On-line duplex molecularly imprinted solid-phase extraction for analysis of low-abundant biomarkers in human serum by liquid chromatography-tandem mass spectrometry

Autorzy: McKitterick, N.; Bicak, T. C.; Switnicka-Plak, M. A.; Cormack, P. A. G.; Reubsaet, L.; Halvorsen, T. G.
Opublikowane w: J. Chromatogr. A, Numer 1655, 2021, ISSN 0021-9673
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.chroma.2021.462490

Discrimination between sialic acid linkage modes using sialyllactose-imprinted polymers

Autorzy: Liliia Mavliutova; Bruna Munoz Aldeguer; Jesper Wiklander; Celina Wierzbicka; Chau Minh Huynh; Ian A. Nicholls; Knut Irgum; Börje Sellergren
Opublikowane w: RSC Advances, Numer 11, 2021, ISSN 2046-2069
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1ra02274a

Display of the human mucinome with defined O-glycans by gene engineered cells

Autorzy: Nason R, Büll C, KonstantinidiA, SunL, Ye Z, HalimA, Wenjuan Du, SørensenD, FurukawaS, MandelU, JoshiH, DworkinL, HansenL, DavidL, IversonR, BensingB, SullamP, VarkiA, de VrieE, de HaanC, VincentelliR, HenrissatB, VakhrushevS, ClausenH, Narimatsu
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 12, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24366-4

Thesis and dissertations (4)

Molecularly Imprinted Polymers for the Analysis of Small Cell Lung Cancer Biomarkers by Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry

Autorzy: Nicholas McKitterick
Opublikowane w: Numer 15017710, 2021, ISSN 1501-7710
Wydawca: University of Oslo

Moleculary imprinted micro- and nanoparticles for cancer associated glycan motifs

Autorzy: Liliia Mavliutova
Opublikowane w: 2021, ISBN 9789178772056
Wydawca: Malmö University

Molecularly imprinted polymers for small cell lung cancer diagnosis

Autorzy: Bicak,Tugrul Cem
Opublikowane w: 2021
Wydawca: University of Strathclyde
DOI: 10.48730/0eyc-aj60

Amino acid sequence and side chain specific synthetic receptors targeting protein phosphorylation

Autorzy: Anil Incel
Opublikowane w: Malmö University, 2021, ISBN 9789178772070
Wydawca: Malmö University
DOI: 10.24834/isbn.9789178772087

Other (2)

Plastantikroppar som hittar cancerceller

Autorzy: EVA BARTONEK ROXÅ
Opublikowane w: Vetenskap och Hälsa, 2019
Wydawca: Lund University

Zirconium(IV)-IMAC for phosphopeptide enrichment in phosphoproteomics

Autorzy: IA Diez; Ireshyn S Govender; Previn Naicker; Stoyan Stoychev; Justin Jordaan; Ole Noerregaard Jensen
Opublikowane w: bioRxiv, 2020
Wydawca: CSHL
DOI: 10.1101/2020.04.13.038810

Conference proceedings (1)

Molecularly Imprinted Polymers for characterization of rare phosphorylation events

Autorzy: Arribas Díez, Ignacio
Opublikowane w: Arribas Díez , I , Anil Incel & Chau Huynh 2019 , ' Molecularly Imprinted Polymers for characterization of rare phosphorylation events ' , Proteomics in Cell Biology and Disease Mechanisms , Heidelberg , Germany , 07/03/2019 - 09/03/2019 ., Numer 1, 2019
Wydawca: EMBL

Prawa własności intelektualnej

Patent (1)

MOLECULARLY IMPRINTED POLYMERS

Numer wniosku/publikacji: 16 793088
Data: 2016-05-09
Wnioskodawca/wnioskodawcy: BUNDESANSTALT FUER MATERIALFORSCHUNG UND -PRUEFUNG