Designer recombinases for efficient and safe genome surgery

Informacje na temat projektu

GENSURGE

Identyfikator umowy o grant: 742133

DOI

10.3030/742133

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 27 Czerwca 2017

Data rozpoczęcia 1 Stycznia 2018

Data zakończenia 30 Czerwca 2024

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 2 380 425,00

Wkład UE

€ 2 380 425,00

Koordynowany przez

TECHNISCHE UNIVERSITAET DRESDEN
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (13)

Prediction of designer-recombinases for DNA editing with generative deep learning

Autorzy: Lukas Theo Schmitt, Maciej Paszkowski-Rogacz, Florian Jug, Frank Buchholz
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 13, 2022, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-35614-6

Quantification of evolved DNA-editing enzymes at scale with DEQSeq

Autorzy: Lukas Theo Schmitt, Aksana Schneider, Jonas Posorski, Felix Lansing, Milica Jelicic, Manavi Jain, Shady Sayed, Frank Buchholz, Duran Sürün
Opublikowane w: Genome Biology, Numer 24, 2023, ISSN 1474-760X
Wydawca: BioMed Central Ltd
DOI: 10.1186/s13059-023-03097-3

Activation of recombinases at specific DNA loci by zinc-finger domain insertions

Autorzy: Liliya Mukhametzyanova, Lukas Theo Schmitt, Julia Torres-Rivera, Teresa Rojo-Romanos, Felix Lansing, Maciej Paszkowski-Rogacz, Heike Hollak, Melanie Brux, Martina Augsburg, Paul Martin Schneider, Frank Buchholz
Opublikowane w: Nature Biotechnology, Numer 1 Feb 2024, 2024, ISSN 1087-0156
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-02121-y

Discovery and characterization of novel Cre-type tyrosine site-specific recombinases for advanced genome engineering

Autorzy: Milica Jelicic, Lukas Theo Schmitt, Maciej Paszkowski-Rogacz, Angelika Walder, Nadja Schubert, Jenna Hoersten, Duran Sürün, Frank Buchholz
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 51, 2023, Strona(/y) 5285-5297, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad366

Engineering spacer specificity of the Cre/loxP system

Autorzy: Jenna Hoersten, Gloria Ruiz-Gómez, Maciej Paszkowski-Rogacz, Giorgio Gilioli, Pedro Manuel Guillem-Gloria, Felix Lansing, M Teresa Pisabarro, Frank Buchholz
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 52, 2024, Strona(/y) 8017-8031, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae481

Conformational dynamics promotes disordered regions from function-dispensable to essential in evolved site-specific DNA recombinases

Autorzy: Carla Guillén-Pingarrón, Pedro M Guillem-Gloria, Anjali Soni, Gloria Ruiz-Gómez, Martina Augsburg, Frank Buchholz, Massimiliano Anselmi, M Teresa Pisabarro
Opublikowane w: Computational and Structural Biotechnology Journal, Numer Volume 20, 2022, Strona(/y) 989-1001, ISSN 2001-0370
Wydawca: Research Network of Computational and Structural
DOI: 10.1016/j.csbj.2022.01.010

Pairing of single mutations yields obligate Cre-type site-specific recombinases

Autorzy: Jenna Hoersten, Gloria Ruiz-Gómez, Felix Lansing, Teresa Rojo-Romanos, Lukas Theo Schmitt, Jan Sonntag, M Teresa Pisabarro, Frank Buchholz
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer Volume 50 Numer 2, 2022, Strona(/y) 1174–1186, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab1240

Precise excision of HTLV-1 provirus with a designer-recombinase

Autorzy: Teresa Rojo-Romanos, Janet Karpinski, Sebastian Millen, Niklas Beschorner, Florian Simon, Maciej Paszkowski-Rogacz, Felix Lansing, Paul Martin Schneider, Jan Sonntag, Joachim Hauber, Andrea K. Thoma-Kress, Frank Buchholz
Opublikowane w: Molecular Therapy, Numer 31, 2023, Strona(/y) 2266-2285, ISSN 1525-0016
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1016/j.ymthe.2023.03.014

A single reporter mouse line for Vika, Flp, Dre, and Cre-recombination

Autorzy: Madina Karimova, Oliver Baker, Aylin Camgoz, Ronald Naumann, Frank Buchholz, Konstantinos Anastassiadis
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-32802-7

Efficient Generation and Correction of Mutations in Human iPS Cells Utilizing mRNAs of CRISPR Base Editors and Prime Editors

Autorzy: Duran Sürün, Aksana Schneider, Jovan Mircetic, Katrin Neumann, Felix Lansing, Maciej Paszkowski-Rogacz, Vanessa Hänchen, Min Ae Lee-Kirsch, Frank Buchholz
Opublikowane w: Genes, Numer 11/5, 2020, Strona(/y) 511, ISSN 2073-4425
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/genes11050511

A heterodimer of evolved designer-recombinases precisely excises a human genomic DNA locus

Autorzy: Felix Lansing, Maciej Paszkowski-Rogacz, Lukas Theo Schmitt, Paul Martin Schneider, Teresa Rojo Romanos, Jan Sonntag, Frank Buchholz
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 48/1, 2019, Strona(/y) 472-485, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkz1078

Nearest-neighbor amino acids of specificity-determining residues influence the activity of engineered Cre-type recombinases

Autorzy: Anjali Soni, Martina Augsburg, Frank Buchholz, M. Teresa Pisabarro
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-70867-5

Correction of a Factor VIII genomic inversion with designer-recombinases

Autorzy: Felix Lansing, Liliya Mukhametzyanova, Teresa Rojo-Romanos, Kentaro Iwasawa, Masaki Kimura, Maciej Paszkowski-Rogacz, Janet Karpinski, Tobias Grass, Jan Sonntag, Paul Martin Schneider, Ceren Günes, Jenna Hoersten, Lukas Theo Schmitt, Natalia Rodriguez-Muela, Ralf Knöfler, Takanori Takebe & Frank Buchholz
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 422 (2022), 2022, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-28080-7