Cellular innovation driving nervous system evolution

Informacje na temat projektu

NeuralCellTypeEvo

Identyfikator umowy o grant: 788921

DOI

10.3030/788921

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 30 Maja 2018

Data rozpoczęcia 1 Czerwca 2018

Data zakończenia 31 Maja 2024

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 2 500 000,00

Wkład UE

€ 2 500 000,00

Koordynowany przez

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (17)

A lamprey neural cell type atlas illuminates the origins of the vertebrate brain

Autorzy: Francesco Lamanna, Francisca Hervas-Sotomayor, A. Phillip Oel, David Jandzik, Daniel Sobrido-Cameán, Gabriel N. Santos-Durán, Megan L. Martik, Jan Stundl, Stephen A. Green, Thoomke Brüning, Katharina Mößinger, Julia Schmidt, Celine Schneider, Mari Sepp, Florent Murat, Jeramiah J. Smith, Marianne E. Bronner, María Celina Rodicio, Antón Barreiro-Iglesias, Daniel M. Medeiros, Detlev Arendt, He
Opublikowane w: Nat Ecol Evol., 2023, ISSN 2397-334X
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41559-023-02170-1

Elementary nervous systems

Autorzy: Detlev Arendt
Opublikowane w: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Numer 376/1821, 2021, Strona(/y) 20200347, ISSN 0962-8436
Wydawca: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2020.0347

Cross-phyla protein annotation by structural prediction and alignment

Autorzy: Fabian Ruperti; Nikolaos Papadopoulos; Jacob M. Musser; Milot Mirdita; Martin Steinegger; Detlev Arendt
Opublikowane w: Genome Biology, Vol 24, Iss 1, Pp 1-21 (2023), Numer 5, 2023, ISSN 1465-6906
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1186/s13059-023-02942-9

MorphoFeatures for unsupervised exploration of cell types, tissues, and organs in volume electron microscopy

Autorzy: Valentyna Zinchenko, Johannes Hugger, Virginie Uhlmann, Detlev Arendt, and Anna Kreshuk
Opublikowane w: elife, 2023, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.80918

Molecular profiling of sponge deflation reveals an ancient relaxant-inflammatory response

Autorzy: Fabian Ruperti, Isabelle Becher, Anniek Stokkermans, Ling Wang, Nick Marschlich, Clement Potel, Emanuel Maus, Frank Stein, Bernhard Drotleff, Klaske J. Schippers, Michael Nickel, Robert Prevedel, Jacob M. Musser, Mikhail M. Savitski, Detlev Arendt
Opublikowane w: Current Biology, 2024, ISSN 0960-9822
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2023.12.021

The conserved core of the nereid brain: Circular CNS, apical nervous system and lhx6-arx-dlx neurons

Autorzy: Detlev Arendt, Idoia Quintana Urzainqui, Hernando Martínez Vergara
Opublikowane w: Current Opinion in Neurobiology, 2021, ISSN 0959-4388
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.conb.2021.11.008

The Nereid on the rise: Platynereis as a model system.

Autorzy: B. Duygu Özpolat; Nadine Randel; Elizabeth A Williams; Luis A Bezares-Calderón; Gabriele Andreatta; Guillaume Balavoine; Paola Bertucci; David E. K. Ferrier; Maria Cristina Gambi; Eve Gazave; Mette Handberg-Thorsager; Jörg D. Hardege; Cameron Hird; Yu-Wen Hsieh; Jerome H.L. Hui; Kevin Nzumbi Mutemi; Stephan Schneider; Oleg Simakov; Hernando Martínez Vergara; Michel Vervoort; Gáspár Jékely;
Opublikowane w: EvoDevo, 2021, ISSN 2041-9139
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.17863/cam.78076

The Evolutionary Assembly of Neuronal Machinery

Autorzy: Detlev Arendt
Opublikowane w: Current Biology, Numer 30/10, 2020, Strona(/y) R603-R616, ISSN 0960-9822
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2020.04.008

Evolution of neuronal types and families

Autorzy: Detlev Arendt, Paola Yanina Bertucci, Kaia Achim, Jacob M Musser
Opublikowane w: Current Opinion in Neurobiology, Numer 56, 2019, Strona(/y) 144-152, ISSN 0959-4388
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.conb.2019.01.022

Mapping single-cell atlases throughout Metazoa unravels cell type evolution

Autorzy: Tarashanksy, A. J., Musser, J. M., Khariton, M., Li, P., Arendt, D., Quake, S. R., Wang, B.
Opublikowane w: eLife, Numer eLife 2021;10:e66747, 2021, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2020.09.28.317784

The dorsoanterior brain of adult amphioxus shares similarities in expression profile and neuronal composition with the vertebrate telencephalon

Autorzy: Èlia Benito-Gutiérrez, Manuel Stemmer, Silvia D Rohr, Laura N Schuhmacher, Jocelyn Tang, Aleksandra Marconi, Gáspár Jékely, Detlev Arendt
Opublikowane w: BMC Biology, Numer 2021 May 21;19(1):110, 2021, ISSN 1741-7007
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1101/307629

MoBIE: a Fiji plugin for sharing and exploration of multi-modal cloud-hosted big image data.

Autorzy: Constantin Pape, Kimberly Meechan, Ekaterina Moreva, Martin Schorb, Nicolas Chiaruttini, Valentyna Zinchenko, Hernando Martinez Vergara, Giulia Mizzon, Josh Moore, Detlev Arendt, Anna Kreshuk, Yannick Schwab, Christian Tischer
Opublikowane w: Nature Methods, 2023, ISSN 1548-7091
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-01776-4

Profiling cellular diversity in sponges informs animal cell type and nervous system evolution

Autorzy: Jacob M. Musser, Klaske J. Schippers, Michael Nickel, Giulia Mizzon, Andrea B. Kohn,Constantin Pape, Paolo Ronchi, Nikolaos Papadopoulos, Alexander J. Tarashansky,Jörg U. Hammel, Florian Wolf, Cong Liang, Ana Hernández-Plaza, Carlos P. Cantalapiedra,Kaia Achim, Nicole L. Schieber, Leslie Pan, Fabian Ruperti1,, Warren R. Francis, Sergio Vargas,Svenja Kling, Maike Renkert, Maxim Polikarpov,, Gleb
Opublikowane w: Science, 2021, ISSN 0036-8075
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1101/758276

Whole-body integration of gene expression and single-cell morphology

Autorzy: Vergara, H. M., Pape, C., Meechan, K. I., Zinchenko, V., Genoud, C., Wanner, A. A., Titze, B., Templin, R. M., Bertucci, P. Y., Simakov, O., Machado, P., Savage, E. L., Schwab, Y., Friedrich, R. W., Kreshuk, A., Tischer, C., Arendt, D.
Opublikowane w: Cell, Numer Cell, 184, 1-19, 2020, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1101/2020.02.26.961037

Many Ways to Build a Polyp

Autorzy: Detlev Arendt
Opublikowane w: Trends in Genetics, Numer 35/12, 2019, Strona(/y) 885-887, ISSN 0168-9525
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2019.09.003

Single cell RNA sequencing of the Strongylocentrotus purpuratus larva reveals the blueprint of major cell types and nervous system of a non-chordate deuterostome.

Autorzy: Periklis Paganos; Danila Voronov; Jacob M. Musser; Detlev Arendt; Maria Ina Arnone
Opublikowane w: eLife, 2021, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.70416

Characterization of eyes, photoreceptors, and opsins in developmental stages of the arrow worm Spadella cephaloptera (Chaetognatha)

Autorzy: Tim Wollesen, Sonia V. Rodriguez Monje, Adam P. Oel, Detlev Arendt
Opublikowane w: J Exp Zool B Mol Dev Evol, 2023, ISSN 1552-5007
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/jez.b.23193

Other (6)

Beyond sequence similarity: cross-phyla protein annotation by structural prediction and alignment

Autorzy: Fabian Ruperti, Nikolaos Papadopoulos, Jacob Musser, Milot Mirdita, Martin Steinegger, Detlev Arendt
Opublikowane w: Biorxiv, 2022
Wydawca: Cold Spring Harbor
DOI: 10.1101/2022.07.05.498892

Single cell RNA sequencing of the Strongylocentrotus purpuratus larva reveals the blueprint of major cell types and nervous system of a non-chordate deuterostome

Autorzy: Paganos, P., Voronov, D., Musser, J. M. Arendt, D., Arnone, M. I
Opublikowane w: bioXriv, 2021
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2021.03.16.435574

MorphoFeatures: unsupervised exploration of cell types, tissues and organs in volume electron microscopy

Autorzy: Valentyna Zinchenko, Johannes Hugger, Virginie Uhlmann, Detlev Arendt, Anna Kreshuk
Opublikowane w: BioRxiv, 2022
Wydawca: CSHL
DOI: 10.1101/2022.05.07.490949

Characterization of eyes, photoreceptors and opsins in developmental stages of the chaetognath Spadella cephaloptera

Autorzy: Tim Wollesena, Sonia Victoria Rodríguez Monje, Adam Phillip Oel, and Detlev Arendt
Opublikowane w: bioXriv, 2019
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/871111

MoBIE: A Fiji plugin for sharing and exploration of multi-modal cloud-hosted big image data

Autorzy: Constantin Pape, Kimberly Meechan, Ekaterina Moreva, Martin Schorb, Nicolas Chiaruttini, Valentyna Zinchenko, Hernando Vergara, Giulia Mizzon, Josh Moore, Detlev Arendt, Anna Kreshuk, Yannick Schwab, Christian Tischer
Opublikowane w: BioRxiv, 2022
Wydawca: CSHL
DOI: 10.1101/2022.05.27.493763

Reconstructing the ancestral vertebrate brain using a lamprey neural cell type atlas

Autorzy: Francesco Lamanna, Francisca Hervas-Sotomayor, A. Phillip Oel, David Jandzik, Daniel Sobrido-Cameán, Megan L. Martik, Stephen A. Green, Thoomke Brüning, Katharina Mößinger, Julia Schmidt, Celine Schneider, Mari Sepp, Florent Murat, Jeramiah J. Smith, Marianne E. Bronner, María Celina Rodicio, Antón Barreiro-Iglesias, Daniel M. Medeiros, Detlev Arendt, Henrik Kaessmann.
Opublikowane w: Biorxiv, 2022
Wydawca: Cold Spring Harbor
DOI: 10.1101/2022.02.28.482278