Opis projektu
Mikrośrodowiskowe czynniki determinujące losy komórek w układzie krwiotwórczym ssaków
Mechanizmy molekularne odpowiedzialne za losy komórek w układzie krwiotwórczym ssaków są słabo poznane. Finansowany przez UE projekt ImmuNiche ma na celu zbadanie składu typów komórek w szpiku kostnym myszy przy użyciu sekwencjonowania RNA pojedynczych komórek i przestrzennej analizy ekspresji genów o wysokiej rozdzielczości w przekrojach tkanek. Przy pomocy tego podejścia zespół zbada kolokalizację komórek krwiotwórczych i innych typów komórek szpiku kostnego oraz postara się przewidzieć nisze progenitorów krwiotwórczych, które ujawniają mikrośrodowiskowe czynniki determinujące los komórek krwiotwórczych. W ramach projektu zbadana zostanie patogeneza zespołów mielodysplastycznych (MDS), które dają początek groźnej dla życia białaczce. Konserwatywne niszowe regulatory losu komórek zaangażowane w patogenezę chorób zostaną określone i funkcjonalnie przeanalizowane w mysich modelach MDS.
Cel
The complex architecture of the mammalian hematopoietic system has been studied for decades, yet the molecular mechanisms underlying cell fate commitment remain poorly understood. Although cytokine signals are major determinants of hematopoietic cell fate, only few niches of stem and progenitor cells have been characterized. Here, we propose to resolve the cell type composition of mouse bone marrow by integrating single-cell RNA-seq with high-resolution spatial analysis of gene expression in tissue sections, visualizing ~250 cell type specific markers by multiplexed single-molecule RNA fluorescent in situ hybridization. This approach will reveal preferential co-localization of hematopoietic cells with other bone marrow-resident cell types, and globally predict niches of hematopoietic progenitor sub-types to pinpoint microenvrionmental determinants of hematopoietic cell fate. Based on this reference we will investigate the role of the microenvironment in the pathogenesis of myelodysplastic syndromes (MDS), representing one of the most frequent blood cell malignancies, commonly giving rise to leukaemia with poor prognosis. To investigate conservation of microenvironmental determinants of normal and malignant hematopoietic differentiation in human, we will apply the same strategy to healthy donors and human MDS patients and compare predicted cell types, differentiation trajectories, and niche interactions to those derived from healthy mice and murine MDS models. This approach will reveal conserved niche regulators of cell fate commitment involved in disease pathogenesis, which we will functionally analyse in murine models to identify novel therapeutic targets for prevention and treatment of MDS. Our approach represents a blueprint for investigating human malignancies of under-characterized tissues by applying cutting-edge high-resolution techniques in combination with advanced computational methods to jointly analyse the murine model and human patient microenvironment.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka RNA
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna onkologia białaczka
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
ERC-COG - Consolidator Grant
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2018-COG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
97070 Wuerzburg
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.