Quantifying minute forces: How mechanoregulation determines the behavior of pathogenic bacteria

Informacje na temat projektu

BacForce

Identyfikator umowy o grant: 852585

DOI

10.3030/852585

Data podpisania przez KE 27 Stycznia 2020

Data rozpoczęcia 1 Sierpnia 2020

Data zakończenia 31 Lipca 2026

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 498 864,00

Wkład UE

€ 1 498 864,00

Koordynowany przez

TECHNISCHE UNIVERSITAT DORTMUND
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (11)

Type-IV pili tune an adhesion-migration trade-off during surface colonization of Pseudomonas aeruginosa

Autorzy: A.N. Simsek, M.D. Koch, J.E. Sanfilippo, Z. Gitai, G. Gompper, B. Sabass
Opublikowane w: bioRxiv Preprint, 2023, ISSN 2692-8205
Wydawca: Cold Spring Harbour Laboratory
DOI: 10.1101/2023.05.09.538458

Sparse inference and active learning of stochastic differential equations from data

Autorzy: Y. Huang, Y. Mabrouk, Gompper, Sabass
Opublikowane w: Sci Rep, Numer 12, 21691, 2022, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-022-25638-9

Sensory adaptation in a continuum model of bacterial chemotaxis—working range, cost-accuracy relation, and coupled systems

Autorzy: Vansh Kharbanda, Benedikt Sabass
Opublikowane w: New Journal of Physics, Numer 26, 2024, Strona(/y) 023045, ISSN 1367-2630
Wydawca: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1367-2630/ad26ba

Bacteria Tune a Trade-off between Adhesion and Migration to Colonize Surfaces under Flow

Autorzy: Ahmet Nihat Simsek, Matthias D. Koch, Joseph E. Sanfilippo, Zemer Gitai, Gerhard Gompper, Benedikt Sabass
Opublikowane w: PRX Life, Numer 2, 2024, ISSN 2835-8279
Wydawca: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/prxlife.2.023003

Multi-Modal Analysis of Satellite Cells Reveals Early Impairments at Pre-Contractile Stages of Myogenesis in Duchenne Muscular Dystrophy

Autorzy: Sophie Franzmeier, Shounak Chakraborty, Armina Mortazavi, Jan B. Stöckl, Jianfei Jiang, Nicole Pfarr, Benedikt Sabass, Thomas Fröhlich, Clara Kaufhold, Michael Stirm, Eckhard Wolf, Jürgen Schlegel, Kaspar Matiasek
Opublikowane w: Cells, Numer 14, 2025, Strona(/y) 892, ISSN 2073-4409
Wydawca: MDPI AG
DOI: 10.3390/cells14120892

Shear force enhances adhesion of Pseudomonas aeruginosa by counteracting pilus-driven surface departure

Autorzy: J.-J. S Palalay, A.N. Simsek, B. Sabass, J.E. Sanfilippo
Opublikowane w: Proc. Nat. Acad. Sci., 2023, ISSN 0027-8424
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1101/2023.05.08.539440

Non-equilibrium dynamics of bacterial colonies -- growth, active fluctuations, segregation, adhesion, and invasion

Autorzy: Kai Zhou, Marc Hennes, Berenike Maier, Gerhard Gompper, Benedikt Sabass
Opublikowane w: Communications Physics, Numer volume 5, Article number: 251, 2022, ISSN 2399-3650
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42005-022-01018-7

Clutch model for focal adhesions predicts reduced self-stabilization under oblique pulling

Autorzy: Andrea Braeutigam, Anton F Burnet, Gerhard Gompper, Benedikt Sabass
Opublikowane w: Journal of Physics: Condensed Matter, Numer 36, 2024, Strona(/y) 295101, ISSN 0953-8984
Wydawca: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1361-648x/ad3ac1

Shear force enhances adhesion of <i>Pseudomonas aeruginosa</i> by counteracting pilus-driven surface departure

Autorzy: Jessica-Jae S. Palalay, Ahmet N. Simsek, Jessie L. Reed, Matthias D. Koch, Benedikt Sabass, Joseph E. Sanfilippo
Opublikowane w: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numer 120, 2023, ISSN 0027-8424
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2307718120

EPB41L5 controls podocyte extracellular matrix assembly by adhesome-dependent force transmission

Autorzy: Jasmin I.Maier, Manuel Rogg, Martin Helmstädter, Alena Sammarco, Oliver Schilling, Benedikt Sabass, Jeffrey H. Miner, Jörn Dengjel, Gerd Walz, Martin Werner, Tobias B.Huber, Christoph Schell
Opublikowane w: Cell Reports, Numer Volume 34, Numer 12, 23 March 2021, 2021, Strona(/y) 108883, ISSN 2211-1247
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2021.108883

A generic self-stabilization mechanism for biomolecular adhesions under load

Autorzy: Braeutigam, Andrea; Simsek, Ahmet Nihat; Gompper, Gerhard; Sabass, Benedikt
Opublikowane w: Nature Communications, Numer volume 13, Article number: 2197, 2022, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-29823-2

Book chapters (2)

Quantitative Analysis of Myofibroblast Contraction by Traction Force Microscopy

Autorzy: Shuying Yang, Fernando R. Valencia, Benedikt Sabass, Sergey V. Plotnikov
Opublikowane w: Methods in Molecular Biology book series (MIMB,volume 2299), 2021
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1007/978-1-0716-1382-5_14

Computational Physics of Active Matter

Autorzy: Sabass, Benedikt and Winkler, Roland G and Auth, Thorsten and Elgeti, Jens and Fedosov, Dmitry A and Ripoll, Marisol and Vliegenthart, Gerard A and Gompper, Gerhard
Opublikowane w: Out-of-equilibrium Soft Matter, 2023, Strona(/y) 354--390
Wydawca: The Royal Society of Chemistry

Thesis and dissertations (3)

Micromechanics of bacterial surface-migration

Autorzy: Ahmet Simsek
Opublikowane w: 2021
Wydawca: Kölner Publikationsserver

Advanced data analysis for traction force microscopy and data-driven discovery of physical equations

Autorzy: Yunfei Huang
Opublikowane w: 2021
Wydawca: Kölner Publikationsserver

Response of stochastic adhesion clusters to pulling and shearing forces.

Autorzy: Andrea Bräutigam
Opublikowane w: 2021
Wydawca: Kölner Publikationsserver

Other (4)

Hijacked Immune Cells Traverse Microenvironmental Barriers by Positioning and Pushing their Intracellular Parasite Cargo

Autorzy: Mauricio J.A. Ruiz-Fernandez, Jianfei Jiang, Armina Mortazavi, Bingzhi Wang, Artur Kuznetcov, Jack Merrin, Markus Meissner, Javier Periz, Benedikt Sabass, Jörg Renkawitz
Opublikowane w: 2024
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.05.03.592378

Not just a number: what cells feel depends on how they grab it

Autorzy: B. Sabass
Opublikowane w: Biophys. J., Numer Volume 121, ISSUE 9, 2022, Strona(/y) 1581-1582
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.bpj.2022.04.004

A reliable<i>in vitro</i>rumen culture system and workflow for screening anti-methanogenic compounds

Autorzy: Philip P. Laric, Armina Mortazavi, Ewa Węgrzyn, Kathrin Simon, Pauline S. Rittel, Florian M. Trefz, Benedikt Sabass
Opublikowane w: 2025
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.03.03.641173

Traction Force Microscopy with DNA FluoroCubes

Autorzy: Armina Mortazavi, Jianfei Jiang, Philip Laric, Dominic A. Helmerich, Rick Seifert, Markus Sauer, Benedikt Sabass
Opublikowane w: 2024
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.04.12.589182