Kontrola Notch architektury komórkowej
Ścieżka Notch to konserwatywny szlak komunikacji komórkowej występujący w królestwie zwierząt, który zaangażowany jest w rozmaite procesy rozwojowe, jak również powiązany z wieloma chorobami, łącznie z rakiem. Naukowcy są zdania, że poza rolą w kontroli losu komórki, ścieżka Notch odpowiada za regulację cytoszkieletu i morfologię komórkową. Jednak dokładne mechanizmy, według których Notch wywiera wpływ na te procesy pozostają nieznane. W związku z tym projekt "Zrozumienie funkcji ścieżki Notch w regulacji architektury komórkowej" (NOTCH AND CELL ARCH) skupił się na identyfikacji i przeanalizowaniu nowych genów docelowych Notch zaangażowanych w ten proces. Poprzez przeprowadzenie analizy całego genomu pod kątem genów regulowanych ścieżką Notch, możliwe było zidentyfikowanie genów kodujących główne białka zaangażowane w morfologię komórki. Zostały one skategoryzowane na podstawie tego, czy przejawiały zmiany w ekspresji lub zostały umiejscowione w pobliżu regionu genomowego zajmowanego przez czynnik transkrypcyjny Su(H), który jest znany z wywoływania odpowiedzi Notch. To doprowadziło do identyfikacji 30 potencjalnych celów Notch o funkcji powiązanej z regulacją zachowania komórki. Funkcję tych celów przetestowano przy użyciu prób opartych na migracji komórek oraz różnicowaniu podczas oogenezy, miogenezy oraz formacji tarcz skrzydła muszki owocowej. Wykorzystując technologię interferencji RNA (RNAi) do zredukowania ekspresji genów, naukowcy zidentyfikowali dziewięć genów, których utrata indukowała fenotypy związane z defektami formowania mięśni, i dwa inne (moezynę i Chickadee), które były wymagane do właściwej organizacji tarczy skrzydła. Oceniono także rolę sygnalizowania Notch w kontrolowaniu ekspresji regulatorów cytoszkieletowych i zachowania komórkowego. Oczekuje się, że analiza trzech genów kandydujących (Reck, Rhea/Talin i Trio) do pozycji wiązania Su(H) i Twist dostarczy ważnych informacji dotyczących implikacji Notch dla ich regulacji transkrypcji. Podsumowując, wyniki projektu NOTCH AND CELL ARCH oferują wiedzę na temat roli ścieżki sygnalizacji Notch w architekturze komórkowej. Biorąc pod uwagę znaczenie sygnalizowania Notch i integralności organizacji komórkowej w wielu typach raka, te nowo zidentyfikowane czynniki mogą mieć istotny wpływ na rozwój przyszłej terapii.
