Postępy w dziedzinie genetyki przeżuwaczy
Zdrowie zwierząt i zrównoważoność są niezbędne dla długofalowej konkurencyjności produkcji małych przeżuwaczy w UE. Odkrywanie podstaw genetycznych cech o decydującym znaczeniu dla zrównoważonego rolnictwa, zwłaszcza w obszarach marginesowych, będzie korzystne dla dobrobytu zwierząt i sektora przeżuwaczy. Finansowany ze środków UE trzyletni wspólny projekt badawczy 3SR(odnośnik otworzy się w nowym oknie) (Sustainable solutions for small ruminants) skupiał się na identyfikacji markerów i mutacji dla trzech cech – podatności na zapalenie sutka, odporności na nicienie oraz współczynnika owulacji. Członkowie projektu blisko współpracowali z międzynarodowym konsorcjum genomiki owcy (International Sheep Genomics Consortium (ISGC)) i międzynarodowym konsorcjum genomu kozy (International Goat Genome Consortium (IGGC)) i opracowali opatrzoną licznymi przypisami referencyjną sekwencję genomu owcy (OARv3.1) cenne narzędzie genomiczne stanowiące podstawę dalszych badań. Opracowali oni również chip o wielkości 50 tys. polimorfizmów pojedynczych nukleotydów (SNP) do wykrywania loci cech ilościowych odpowiedzialnych za odporność na nicienie u kóz, który ma być wykorzystywany w nowatorskich strategiach hodowlanych. Najnowocześniejsze techniki genomiczne, w tym przeglądarka genomów o otwartym dostępie, pomogły uzyskać dane dotyczące genomu z około 7 500 zwierząt, sekwencje całego genomu dla 50 owiec i ponad terabajt danych sekwencji RNA. Dane zidentyfikowały mutacje przyczynowe, geny kandydujące, SNP i markery genetyczne dla regionów mających wpływ na badane cechy. Wyniki obejmują poziomy somatycznej liczby komórek (wskaźnik podatności na zapalenie sutka), odporność na nicienie i współczynnik owulacji. Te istotne regiony genomiczne zostaną zbadane przy pomocy narzędzi bioinformatycznych oraz zastosowaniu wysokorozdzielczych map porównawczych zarówno dla owiec jak i kóz. Popularyzacja obejmowała strona projektu(odnośnik otworzy się w nowym oknie), 12 artykułów w czasopismach naukowych, 66 prezentacji na 33 krajowych i międzynarodowych konferencjach i cztery artykuły prasowe. W celu zwiększenia świadomości dotyczącej badań i ułatwienia ich upowszechnienia oraz zastosowania w całym sektorze przeżuwaczy, w ramach projektu 3SR został wydany biuletyn techniczny. Odbyło się siedemnaście spotkań w siedmiu krajach, na których członkowie projektu omawiali implikacje wyników i osiągnięć projektu 3SR z hodowcami, doradcami, zrzeszeniami hodowców, firmami hodowlanymi i przedstawicielami sektora. Partnerzy optymistycznie zakładają, że zidentyfikowane markery genetyczne pomogą zapewnić zwiększoną odporność na zapalenie sutka i zakażenia nicieniami w UE, co przekłada się na znaczną oszczędność kosztów dla przemysłu owczarskiego. Szersza wiedza na temat współczynnika owulacji ma również zapewnić znaczne korzyści pod względem poprawy produktywności.
