Zrozumienie różnorodności genetycznej prątków gruźlicy
Po zakażeniu bakterią MTB, gruźlica rozwija się u zaledwie 5–10% immunokompetentnych osób. Wirulencja zakażającego szczepu i czynniki genetyczne żywiciela odpowiadają za różnice w poziomach infekcji u poszczególnych osób. Szczepy mykobakteryjne z rodziny W-Beijing zwróciły na siebie uwagę ze względu wysoką chorobowość i wskaźnik śmiertelności, jak i odporność na leki przeciwdrobnoustrojowe. Szczepy te pojawiły się w chińskiej prowincji Pekin i – jak zaobserwowano – hamowały reakcje immunologiczne żywiciela poprzez ekspresję glikolipidu fenolowego. Ich zdolność do rozprzestrzeniania się lokalnie prawdopodobnie odzwierciedla wysoki poziom sprawności mykobakteryjnych szczepów W-Beijing i jest spowodowana niezidentyfikowanymi czynnikami wirulencji. Celem finansowanego przez UE projektu TB-VIR jest wyjaśnienie czynników genetycznych powodujących wysoką wirulencję tych szczepów. Naukowcy wyjaśnili różnorodność genetyczną szczepów W-Beijing na podstawie analizy genotypowania metodą polimorfizmu jednego nukleotydu (SNP) i rozróżnili je na podstawie kolejno uzyskiwanych mutacji punktowych. Obrazowanie funkcjonalne biblioteki mutacji MTB wykorzystano do identyfikacji wirulentnych genów w szczepach W-Beijing, jak również genów wymaganych do infekcji makrofagów. Członkowie projektu TB-VIR przeprowadzili także analizę porównawczą zmian w ekspresji genów komórek żywiciela w następstwie infekcji szczepami mykobakteryjnymi W-Beijing oraz szczepami innych genotypów. Reakcje odpornościowe żywiciela na szczepy W-Beijing i inne genotypy zostały dokładnie zbadane w celu zrozumienia relacji między genotypem a fenotypem i interakcji bakteria-żywiciel. Biorąc pod uwagę fakt, że globalny zasięg występowania TB rośnie o 2% rocznie, działania zespołu TB-VIR dostarczyły bezcennych informacji na temat roli różnorodności genetycznej MTB w rozwoju choroby. Konsorcjum ma nadzieję, że dzięki zrozumieniu efektywności epidemiologicznej określonych szczepów MTB, uda się zaprojektować nowe środki kontroli choroby wraz z nowymi narzędziami diagnostycznymi.
