Artificial RNA regulators to probe, control, and design gene regulatory networks in bacteria

Informacje na temat projektu

ArtRNA

Identyfikator umowy o grant: 101088027

DOI

10.3030/101088027

Data podpisania przez KE 31 Marca 2023

Data rozpoczęcia 1 Listopada 2023

Data zakończenia 31 Października 2028

Finansowanie w ramach

• European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 999 913,00

Wkład UE

€ 1 999 913,00

Koordynowany przez

FRIEDRICH-SCHILLER-UNIVERSITÄT JENA
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Drafting of Data Management Plan

Publikacje

Peer reviewed articles (10)

An RNA sponge directs the transition from feast to famine in Caulobacter crescentus

Autorzy: Laura N. Vogt, Manuel Velasco Gomariz, Malte Siemers, Kai Papenfort, Kathrin S. Fröhlich
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 16, 2025, ISSN 2041-1723
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-025-65274-1

ProQ-associated small RNAs control motility in <i>Vibrio cholerae</i>

Autorzy: Rabea Ghandour; Daniel Devlitsarov; Phillip Popp; Sahar Melamed; Michaela Huber; Malte Siemers; Thomas Krüger; Olaf Kniemeyer; Andreas Klingl; Axel A Brakhage; Marc Erhardt; Kai Papenfort
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.18452/33833

Phage–phage competition and biofilms affect interactions between two virulent bacteriophages and <i>Pseudomonas aeruginosa</i>

Autorzy: Bürkle, Magdalena; Korf, Imke; Lippegaus, Anne; Krautwurst, Sebastian; Rohde, Christine; Weissfuss, Chantal; Nouailles, Geraldine; Tene, Xavière Menatong; Gaborieau, Baptiste; Ghigo, Jean-Marc; Ricard, Jean-Damien; Hocke, Andreas; Papenfort, Kai; Debarbieux, Laurent; Witzenrath, Martin; Wienhold, Sandra-Maria; Krishnamoorthy, Gopinath
Opublikowane w: The ISME Journal, 2025, ISSN 1751-7370
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1093/ISMEJO/WRAF065

ChimericFragments: Computation, analysis, and visualization of global RNA networks

Autorzy: Malte Siemers; Anne Lippegaus; Kai Papenfort
Opublikowane w: NAR Genomics and Bioinformatics, 2023, ISSN 2631-9268
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.1093/NARGAB/LQAE035

Insights into bacterial metabolism from small RNAs

Autorzy: Kai Papenfort; Gisela Storz
Opublikowane w: Cell Chemical Biology, 2024, ISSN 2451-9448
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/J.CHEMBIOL.2024.07.002

Quorum sensing employs a dual regulatory mechanism to repress T3SS gene expression

Autorzy: Payel Paul; Ram Podicheti; Logan J. Geyman; Elizabeth N. Baker; Kai Papenfort; Douglas B. Rusch; Julia C. van Kessel
Opublikowane w: mBio, 2025, ISSN 2150-7511
Wydawca: ASM
DOI: 10.1128/MBIO.00106-25

Small RNAs direct attack and defense mechanisms in a quorum sensing phage and its host

Autorzy: Marcel Sprenger, Malte Siemers, Sebastian Krautwurst, Kai Papenfort
Opublikowane w: Cell Host &amp; Microbe, Numer 32, 2024, ISSN 1931-3128
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.CHOM.2024.03.010

Extracellular Vesicles From <i>Xylella fastidiosa</i> Carry sRNAs and Genomic Islands, Suggesting Roles in Recipient Cells

Autorzy: Alessa Ruf; Patrick Blumenkamp; Christina Ludwig; Anne Lippegaus; Andreas Brachmann; Andreas Klingl; Alexander Goesmann; Karina Brinkrolf; Kai Papenfort; Silke Robatzek
Opublikowane w: Journal of Extracellular Vesicles, 2025, ISSN 2001-3078
Wydawca: WILEY
DOI: 10.1002/JEV2.70102

Genome-wide profiling of Hfq-bound RNAs reveals the iron-responsive small RNA RusT in <i>Caulobacter crescentus</i>

Autorzy: Vogt, Laura N; Panis, Gaël; Schäpers, Anna; Peschek, Nikolai; Huber, Michaela; Papenfort, Kai; Viollier, Patrick; Fröhlich, Kathrin S
Opublikowane w: mBio, 2024, ISSN 2150-7511
Wydawca: ASM
DOI: 10.1128/MBIO.03153-23

The global RNA–RNA interactome of<i>Klebsiella pneumoniae</i>unveils a small RNA regulator of cell division

Autorzy: Eric Ruhland; Malte Siemers; Ruman Gerst; Felix Späth; Laura Nicole Vogt; Marc Thilo Figge; Kai Papenfort; Kathrin Sophie Fröhlich
Opublikowane w: Proceedings of the National Academy of Sciences, 2024, ISSN 1091-6490
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/PNAS.2317322121