Identification and functional characterization of mammalian enhancers and transcriptional co-factors during cellular signaling and cell fate transitions

Informacje na temat projektu

Enhancer ID

Identyfikator umowy o grant: 647320

DOI

10.3030/647320

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 19 Maja 2015

Data rozpoczęcia 1 Września 2015

Data zakończenia 31 Stycznia 2022

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 999 906,00

Wkład UE

€ 1 999 906,00

Koordynowany przez

FORSCHUNGSINSTITUT FUR MOLEKULARE PATHOLOGIE GESELLSCHAFT MBH
Austria

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Other (1)

DeepSTARR predicts enhancer activity from DNA sequence and enables the de novo design of enhancers

Autorzy: Bernardo P. de Almeida, Franziska Reiter, Michaela Pagani, Alexander Stark
Opublikowane w: bioRxiv, 2021
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2021.10.05.463203

Peer reviewed articles (6)

STARR-seq and UMI-STARR-seq: Assessing Enhancer Activities for Genome-Wide-, High-, and Low-Complexity Candidate Libraries.

Autorzy: Christoph Neumayr; Michaela Pagani; Alexander Stark; Alexander Stark; Cosmas D. Arnold
Opublikowane w: Current Protocols in Molecular Biology, Numer 2, 2019, ISSN 1934-3647
Wydawca: John Wiley and Sons Inc
DOI: 10.1002/cpmb.105

Genome-wide assessment of sequence-intrinsic enhancer responsiveness at single-base-pair resolution

Autorzy: Cosmas D Arnold, Muhammad A Zabidi, Michaela Pagani, Martina Rath, Katharina Schernhuber, Tomáš Kazmar, Alexander Stark
Opublikowane w: Nature Biotechnology, Numer 35/2, 2017, Strona(/y) 136-144, ISSN 1087-0156
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nbt.3739

Assessing sufficiency and necessity of enhancer activities for gene expression and the mechanisms of transcription activation

Autorzy: Rui R. Catarino, Alexander Stark
Opublikowane w: Genes & Development, Numer 32/3-4, 2018, Strona(/y) 202-223, ISSN 0890-9369
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gad.310367.117

Probing the canonicity of the Wnt/Wingless signaling pathway

Autorzy: Alexandra Franz, Daria Shlyueva, Erich Brunner, Alexander Stark, Konrad Basler
Opublikowane w: PLOS Genetics, Numer 13/4, 2017, Strona(/y) e1006700, ISSN 1553-7404
Wydawca: PLOS Genetics
DOI: 10.1371/journal.pgen.1006700

Resolving systematic errors in widely used enhancer activity assays in human cells

Autorzy: Felix Muerdter, Łukasz M Boryń, Ashley R Woodfin, Christoph Neumayr, Martina Rath, Muhammad A Zabidi, Michaela Pagani, Vanja Haberle, Tomáš Kazmar, Rui R Catarino, Katharina Schernhuber, Cosmas D Arnold, Alexander Stark
Opublikowane w: Nature Methods, Numer 15/2, 2018, Strona(/y) 141-149, ISSN 1548-7091
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nmeth.4534

A high‐throughput method to identify trans‐activation domains within transcription factor sequences

Autorzy: Cosmas D Arnold, Filip Nemčko, Ashley R Woodfin, Sebastian Wienerroither, Anna Vlasova, Alexander Schleiffer, Michaela Pagani, Martina Rath, Alexander Stark
Opublikowane w: The EMBO Journal, Numer 37/16, 2018, ISSN 0261-4189
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.201798896