Single-molecule visualization of transcription dynamics to understand regulatory mechanisms of transcriptional bursting and its effects on cellular fitness

Informacje na temat projektu

BURSTREG

Identyfikator umowy o grant: 755695

DOI

10.3030/755695

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 6 Września 2017

Data rozpoczęcia 1 Stycznia 2018

Data zakończenia 31 Grudnia 2022

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 950 775,00

Wkład UE

€ 1 950 775,00

Koordynowany przez

STICHTING HET NEDERLANDS KANKER INSTITUUT-ANTONI VAN LEEUWENHOEK ZIEKENHUIS
Netherlands

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (8)

Optimized protocol for single-molecule RNA FISH to visualize gene expression in S. cerevisiae

Autorzy: Heta P Patel, Ineke Brouwer, Tineke L Lenstra
Opublikowane w: STAR Protocols, 2021, ISSN 2666-1667
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.xpro.2021.100647

The Hda1 histone deacetylase limits divergent non-coding transcription and restricts transcription initiation frequency

Autorzy: Uthra Gowthaman, Maxim Ivanov, Isabel Schwarz, Heta P Patel, Niels A Müller, Desiré García-Pichardo, Tineke L Lenstra, Sebastian Marquardt
Opublikowane w: EMBO Journal, Numer (2021)40:e108903, 2021, ISSN 1460-2075
Wydawca: EMBO press
DOI: 10.15252/embj.2021108903

Single-Molecule Fluorescence Imaging in Living Saccharomyces cerevisiae Cells

Autorzy: Ineke Brouwer; Joseph Victor Willem Meeussen; Heta Piyush Patel; Wim Pomp; Tineke L. Lenstra
Opublikowane w: STAR Protocols, Vol 1, Iss 3, Pp 100142- (2020), Numer 1, 2020, ISSN 2666-1667
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.xpro.2020.100142

Transcription-replication coordination revealed in single live cells

Autorzy: Ioannis Tsirkas; Daniel Dovrat; Manikandan Thangaraj; Ineke Brouwer; Amit Cohen; Zohar Paleiov; Michael M Meijler; Tineke Lenstra; Amir Aharoni
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 2, 2022, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac069

Live‐cell imaging reveals the interplay between transcription factors, nucleosomes, and bursting

Autorzy: Benjamin T Donovan, Anh Huynh, David A Ball, Heta P Patel, Michael G Poirier, Daniel R Larson, Matthew L Ferguson, Tineke L Lenstra
Opublikowane w: The EMBO Journal, Numer 38/12, 2019, Strona(/y) e100809, ISSN 0261-4189
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.2018100809

Visualizing transcription: key to understanding gene expression dynamics

Autorzy: Ineke Brouwer, Tineke L Lenstra
Opublikowane w: Current Opinion in Chemical Biology, Numer 51, 2019, Strona(/y) 122-129, ISSN 1367-5931
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cbpa.2019.05.031

Quantifying how post-transcriptional noise and gene copy number variation bias transcriptional parameter inference from mRNA distributions

Autorzy: Heta P Patel; Xiaoming Fu; Stefano Coppola; Libin Xu; Zhixing Cao; Tineke L Lenstra; Ramon Grima
Opublikowane w: Elife, Numer 1, 2022, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.82493

Following the tracks: How transcription factor binding dynamics control transcription.

Autorzy: Wim J de Jonge, Heta P Patel, Joseph V W Meeussen, Tineke L Lenstra
Opublikowane w: Biophysical Journal, 2022, ISSN 1542-0086
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.bpj.2022.03.026