Genetics of Individuality

Informacje na temat projektu

IndiGene

Identyfikator umowy o grant: 810172

DOI 10.3030/810172

Data podpisania przez KE 18 Stycznia 2019

Data rozpoczęcia 1 Lutego 2019

Data zakończenia 31 Lipca 2025

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity € 6 272 613,00

Wkład UE € 6 272 613,00

Koordynowany przez

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Germany

Rezultaty

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Data Management Plan for the Open Research Data Pilot

Publikacje

Peer reviewed articles (8)

Genomic variations and epigenomic landscape of the Medaka Inbred Kiyosu-Karlsruhe (MIKK) panel

Autorzy: Adrien Leger, Ian Brettell, Jack Monahan, Carl Barton, Nadeshda Wolf, Natalja Kusminski, Cathrin Herder, Narendar Aadepu, Clara Becker, Jakob Gierten, Omar T. Hammouda, Eva Hasel, Colin Lischik, Katharina Lust, Natalia Sokolova, Risa Suzuki, Tinatini Tavhelidse, Thomas Thumberger, Erika Tsingos, Philip Watson, Bettina Welz, Kiyoshi Naruse, Felix Loosli, Joachim Wittbrodt, Ewan Birney & Tomas Fitzg
Opublikowane w: Genome Biology, Numer 23, Article number: 58, 2022, ISSN 1474-760X
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1186/s13059-022-02602-4

Fish primary embryonic pluripotent cells assemble into retinal tissue mirroring in vivo early eye development

Autorzy: Lucie Zilova, Venera Weinhardt, Tinatini Tavhelidse, Christina Schlagheck, Thomas Thumberger, Joachim Wittbrodt
Opublikowane w: eLife, Numer 10, 2021, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.66998

Boosting targeted genome editing using the hei-tag

Autorzy: Thomas ThumbergerTinatini Tavhelidse-SuckJose Arturo Gutierrez-TrianaAlex CorneanRebekka MedertBettina WelzMarc FreichelJoachim Wittbrodt
Opublikowane w: eLife, 2022, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.70558

The Medaka Inbred Kiyosu-Karlsruhe (MIKK) panel

Autorzy: Tomas Fitzgerald, Ian Brettell, Adrien Leger, Nadeshda Wolf, Natalja Kusminski, Jack Monahan, Carl Barton, Cathrin Herder, Narendar Aadepu, Jakob Gierten, Clara Becker, Omar T. Hammouda, Eva Hasel, Colin Lischik, Katharina Lust, Natalia Sokolova, Risa Suzuki, Erika Tsingos, Tinatini Tavhelidse, Thomas Thumberger, Philip Watson, Bettina Welz, Nadia Khouja, Kiyoshi Naruse, Ewan Birney, Joachim Wittb
Opublikowane w: Genome Biology, Numer 23, Article number: 59, 2022, ISSN 1474-760X
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1186/s13059-022-02623-z

Automated high-throughput heartbeat quantification in medaka and zebrafish embryos under physiological conditions

Autorzy: Jakob Gierten, Christian Pylatiuk, Omar T. Hammouda, Christian Schock, Johannes Stegmaier, Joachim Wittbrodt, Jochen Gehrig, Felix Loosli
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-58563-w

De novo PAM generation to reach initially inaccessible target sites for base editing

Autorzy: Kaisa Pakari, Joachim Wittbrodt, Joachim Wittbrodt
Opublikowane w: Development, 2023, ISSN 0950-1991
Wydawca: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dev.201115

CRISPR-based knockout and base editing confirm the role of MYRF in heart development and congenital heart disease

Autorzy: Lino Doering, Alex Cornean, Thomas Thumberger, Joergen Benjaminsen, Beate Wittbrodt, Tanja Kellner, Omar T. Hammouda, Matthias Gorenflo, Joachim Wittbrodt and Jakob Gierten
Opublikowane w: | Disease Models & Mechanisms, 2023, ISSN 1754-8403
Wydawca: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dmm.049811

Precise in vivo functional analysis of DNA variants with base editing using ACEofBASEs target prediction

Autorzy: Alex Cornean, Jakob Gierten, Bettina Welz, Juan Luis Mateo, Thomas Thumberger, Joachim Wittbrodt
Opublikowane w: eLife, 2022, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.72124