Understanding Circumventing Antibiotic REsistance

Informacje na temat projektu

uCARE

Identyfikator umowy o grant: 819454

DOI

10.3030/819454

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 14 Lutego 2019

Data rozpoczęcia 1 Marca 2019

Data zakończenia 31 Sierpnia 2024

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 986 004,00

Wkład UE

€ 1 986 004,00

Koordynowany przez

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (10)

SARS-CoV-2 infection remodels the host protein thermal stability landscape.

Autorzy: Joel Selkrig; Megan L. Stanifer; André Mateus; Karin Mitosch; Inigo Barrio-Hernandez; Mandy Rettel; Heeyoung Kim; Carlos G P Voogdt; Philipp Walch; Philipp Walch; Carmon Kee; Nils Kurzawa; Nils Kurzawa; Frank Stein; Clement M. Potel; Anna Jarzab; Bernhard Kuster; Ralf Bartenschlager; Ralf Bartenschlager; Steeve Boulant; Steeve Boulant; Pedro Beltrao; Athanasios Typas; Mikhail M. Savitski
Opublikowane w: Molecular Systems Biology, Vol 17, Iss 2, Pp n/a-n/a (2021), Numer 1, 2021, ISSN 1744-4292
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.21203/rs.3.rs-105193/v1

Harnessing gut microbial communities to unravel microbiome functions

Autorzy: Samir Giri, Handuo Shi, Athanasios Typas, Kerwyn Casey Huang
Opublikowane w: Current Opinion in Microbiology, Numer 83, 2025, Strona(/y) 102578, ISSN 1369-5274
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.mib.2024.102578

Randomly barcoded transposon mutant libraries for gut commensals II: Applying libraries for functional genetics

Autorzy: Carlos Geert Pieter Voogdt, Surya Tripathi, Stefan Oliver Bassler, Saria A. McKeithen-Mead, Emma R. Guiberson, Alexandra Koumoutsi, Afonso Martins Bravo, Cullen Buie, Michael Zimmermann, Justin L. Sonnenburg, Athanasios Typas, Adam M. Deutschbauer, Anthony L. Shiver, Kerwyn Casey Huang
Opublikowane w: Cell Reports, Numer 43, 2024, Strona(/y) 113519, ISSN 2211-1247
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2023.113519

Unravelling the collateral damage of antibiotics on gut bacteria

Autorzy: Lisa Maier, Camille V. Goemans, Jakob Wirbel, Michael Kuhn, Claudia Eberl, Mihaela Pruteanu, Patrick Müller, Sarela Garcia-Santamarina, Elisabetta Cacace, Boyao Zhang, Cordula Gekeler, Tisya Banerjee, Exene Erin Anderson, Alessio Milanese, Ulrike Löber, Sofia K. Forslund, Kiran Raosaheb Patil, Michael Zimmermann, Bärbel Stecher, Georg Zeller, Peer Bork, Athanasios Typas
Opublikowane w: Nature, Numer 599/7883, 2021, Strona(/y) 120-124, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-03986-2

Bioactivity assessment of natural compounds using machine learning models trained on target similarity between drugs

Autorzy: Vinita Periwal, Stefan Bassler, Sergej Andrejev, Natalia Gabrielli, Kaustubh Raosaheb Patil, Athanasios Typas, Kiran Raosaheb Pati
Opublikowane w: PLOS Computational Biology, 2023, ISSN 1553-7358
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1010029

Randomly barcoded transposon mutant libraries for gut commensals I: Strategies for efficient library construction

Autorzy: Surya Tripathi, Carlos Geert Pieter Voogdt, Stefan Oliver Bassler, Mary Anderson, Po-Hsun Huang, Nazgul Sakenova, Tümay Capraz, Sunit Jain, Alexandra Koumoutsi, Afonso Martins Bravo, Valentine Trotter, Michael Zimmerman, Justin L. Sonnenburg, Cullen Buie, Athanasios Typas, Adam M. Deutschbauer, Anthony L. Shiver, Kerwyn Casey Huang
Opublikowane w: Cell Reports, Numer 43, 2024, Strona(/y) 113517, ISSN 2211-1247
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2023.113517

High-throughput anaerobic screening for identifying compounds acting against gut bacteria in monocultures or communities

Autorzy: Patrick Müller, Jacobo de la Cuesta-Zuluaga, Michael Kuhn, Maral Baghai Arassi, Tim Treis, Sonja Blasche, Michael Zimmermann, Peer Bork, Kiran Raosaheb Patil, Athanasios Typas, Sarela Garcia-Santamarina, Lisa Maier
Opublikowane w: Nature Protocols, Numer 19, 2024, Strona(/y) 668-699, ISSN 1754-2189
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41596-023-00926-4

Emergence of community behaviors in the gut microbiota upon drug treatment

Autorzy: Sarela Garcia-Santamarina, Michael Kuhn, Saravanan Devendran, Lisa Maier, Marja Driessen, André Mateus, Eleonora Mastrorilli, Ana Rita Brochado, Mikhail M. Savitski, Kiran R. Patil, Michael Zimmermann, Peer Bork, Athanasios Typas
Opublikowane w: Cell, Numer 187, 2024, Strona(/y) 6346-6357.e20, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2024.08.037

Systematic mapping of antibiotic cross-resistance and collateral sensitivity with chemical genetics

Autorzy: Nazgul Sakenova, Elisabetta Cacace, Askarbek Orakov, Florian Huber, Vallo Varik, George Kritikos, Jan Michiels, Peer Bork, Pascale Cossart, Camille V. Goemans, Athanasios Typas
Opublikowane w: Nature Microbiology, Numer 10, 2025, Strona(/y) 202-216, ISSN 2058-5276
Wydawca: Springer Nature Limited
DOI: 10.1038/s41564-024-01857-w

Towards a mechanistic understanding of reciprocal drug–microbiome interactions

Autorzy: Michael Zimmermann, Kiran Raosaheb Patil, Athanasios Typas, Lisa Maier
Opublikowane w: Molecular Systems Biology, Numer 17/3, 2021, ISSN 1744-4292
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.202010116

Other (1)

Emergence of community behaviors in the gut microbiota upon drug treatment

Autorzy: Sarela Garcia-Santamarina, Michael Kuhn, Saravanan Devendran, Lisa Maier, Marja Driessen, André Mateus, Eleonora Mastrorilli, Ana Rita Brochado, Mikhail M. Savitski, Kiran R. Patil, Michael Zimmermann, Peer Bork, Athanasios Typas
Opublikowane w: bioRxiv, 2023
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.06.13.544832

Prawa własności intelektualnej

Patent (1)

COMPOUNDS AND PHARMACEUTICAL COMPOSITIONS FOR PREVENTION AND/OR TREATMENT OF DYSBIOSIS AND ANTIBACTERIAL ANTIDOTES FOR MICROBIOME-PROTECTION

Numer wniosku/publikacji: 19 216548
Data: 2019-12-16
Wnioskodawca/wnioskodawcy: EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY