Rational Engineering of Synthetic Systems for Propagation of Information via Catalytic Assembly of Copies

Informacje na temat projektu

RESSPICAC

Identyfikator umowy o grant: 851910

DOI

10.3030/851910

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 30 Października 2019

Data rozpoczęcia 1 Listopada 2019

Data zakończenia 31 Grudnia 2025

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 499 433,00

Wkład UE

€ 1 499 433,00

Koordynowany przez

IMPERIAL COLLEGE OF SCIENCE TECHNOLOGY AND MEDICINE
United Kingdom

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Develop a Data Management Plan (DMP) to help provide open access to research data

Publikacje

Peer reviewed articles (11)

Thermodynamic limits in far-from-equilibrium molecular templating networks

Autorzy: Benjamin Qureshi, Jenny M. Poulton, Thomas E. Ouldridge
Opublikowane w: Newton, Numer 2, 2026, Strona(/y) 100302, ISSN 2950-6360
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.newton.2025.100302

A universal method for analyzing copolymer growth

Autorzy: Benjamin Qureshi, Jordan Juritz, Jenny M. Poulton, Adrian Beersing-Vasquez, Thomas E. Ouldridge
Opublikowane w: The Journal of Chemical Physics, Numer 158, 2023, Strona(/y) 104906, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0133489

Kinetic Proofreading Can Enhance Specificity in a Nonenzymatic DNA Strand Displacement Network

Autorzy: Rakesh Mukherjee, Aditya Sengar, Javier Cabello-García, Thomas E. Ouldridge
Opublikowane w: Journal of the American Chemical Society, Numer 146, 2024, Strona(/y) 18916-18926, ISSN 0002-7863
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c14673

The interplay of heterogeneity and product detachment in templated polymer copying

Autorzy: Jeremy E. B. Guntoro, Benjamin J. Qureshi, Thomas E. Ouldridge
Opublikowane w: The Journal of Chemical Physics, Numer 162, 2025, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0245687

Minimal mechanism for cyclic templating of length-controlled copolymers under isothermal conditions

Autorzy: Jordan Juritz; Jenny M. Poulton; Thomas E. Ouldridge
Opublikowane w: Journal of Chemical Physics, Numer 156, 2022, Strona(/y) 074103, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0077865

Overcoming the Speed Limit of Four-Way DNA Branch Migration with Bulges in Toeholds

Autorzy: Samia Bakhtawar, Francesca Smith, Aditya Sengar, Guy-Bart V. Stan, John Goertz, Molly Stevens, Thomas E. Ouldridge, Wooli Bae
Opublikowane w: Nano Letters, Numer 25, 2025, Strona(/y) 13772-13779, ISSN 1530-6984
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.5c03063

Information propagation through enzyme-free catalytic templating of DNA dimerization with weak product inhibition

Autorzy: Javier Cabello-Garcia, Rakesh Mukherjee, Wooli Bae, Guy-Bart V. Stan, Thomas E. Ouldridge
Opublikowane w: Nature Chemistry, Numer 17, 2025, Strona(/y) 1179-1187, ISSN 1755-4330
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41557-025-01831-x

Design of DNA strand displacement reactions

Autorzy: Križan Jurinović, Merry Mitra, Rakesh Mukherjee, Thomas E Ouldridge
Opublikowane w: Current Opinion in Biotechnology, Numer 97, 2026, Strona(/y) 103396, ISSN 0958-1669
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.copbio.2025.103396

Handhold-Mediated Strand Displacement: A Nucleic Acid Based Mechanism for Generating Far-from-Equilibrium Assemblies through Templated Reactions

Autorzy: Javier Cabello-Garcia, Wooli Bae, Guy-Bart V. Stan, Thomas E. Ouldridge
Opublikowane w: ACS Nano, Numer 15/2, 2021, Strona(/y) 3272-3283, ISSN 1936-0851
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.0c10068

Recurrent neural chemical reaction networks that approximate arbitrary dynamics

Autorzy: Dack, Alexander; Qureshi, Benjamin; Ouldridge, Thomas E.; Plesa, Tomislav
Opublikowane w: Cell Systems, Numer in press, 2026, ISSN 2405-4720
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.48550/arxiv.2406.03456

A Primer on the oxDNA Model of DNA: When to Use it, How to Simulate it and How to Interpret the Results

Autorzy: A. Sengar, T. E. Ouldridge, O. Henrich, L. Rovigatti, P. Šulc
Opublikowane w: Frontiers in Molecular Biosciences, Numer 8, 2021, ISSN 2296-889X
Wydawca: Frontiers
DOI: 10.3389/fmolb.2021.693710

Non-peer reviewed articles (1)

Setting a direction for molecular recognition

Autorzy: Thomas E. Ouldridge, Rakesh Mukherjee
Opublikowane w: Nature Nanotechnology, Numer 20, 2025, Strona(/y) 1359-1360, ISSN 1748-3387
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41565-025-01997-y