Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Linking within-host and between-host evolution of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Mycobacterium tuberculosis complex Lineage 1: A neglected cause of tuberculosis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Venus Marie R. Rojas, Michaela Zwyer, Selim Bouaouina, Daniela Brites, Sonia Borrell, Sebastien Gagneux
Opublikowane w: PLOS Neglected Tropical Diseases, Numer 19, 2025, Strona(/y) e0013513, ISSN 1935-2735
Wydawca: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/journal.pntd.0013513

Phylogenomics of Mycobacterium africanum reveals a new lineage and a complex evolutionary history. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Mireia Coscolla; Daniela Brites; Daniela Brites; Fabrizio Menardo; Fabrizio Menardo; Chloé Loiseau; Chloé Loiseau; Sonia Borrell; Sonia Borrell; Isaac Darko Otchere; Adwoa Asante-Poku; Prince Asare; Leonor Sánchez-Busó; Leonor Sánchez-Busó; Florian Gehre; C. N’Dira Sanoussi; Martin Antonio; Affolabi Dissou; Paula Ruiz-Rodríguez; Janet A. M. Fyfe; Erik C. Böttger; Patrick Becket; Stefan N
Opublikowane w: Microbial Genomics, Numer 2, 2021, ISSN 2057-5858
Wydawca: Microbial Society
DOI: 10.17863/cam.64924

Expression Dysregulation as a Mediator of Fitness Costs in Antibiotic Resistance (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Trauner A, Banaei-Esfahani A, Gygli SM, Warmer P, Feldmann J, Zampieri M, Borrell S, Collins BC, Beisel C, Aebersold R, Gagneux S.
Opublikowane w: Antimicrob Agents Chemother, 2021, ISSN 0021-9193
Wydawca: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aac.00504-21

Effect of compensatory evolution in the emergence and transmission of rifampicin-resistant Mycobacterium tuberculosis in Cape Town, South Africa: a genomic epidemiology study (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Galo A Goig, Fabrizio Menardo, Zubeida Salaam-Dreyer, Anzaan Dippenaar, Elizabeth M Streicher, Johnny Daniels, Anja Reuter, Sonia Borrell, Miriam Reinhard, Anna Doetsch, Christian Beisel, Robin M Warren, Helen Cox, Sebastien Gagneux
Opublikowane w: The Lancet Microbe, Numer 4, 2023, Strona(/y) e506-e515, ISSN 2666-5247
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/s2666-5247(23)00110-6

Mycobacterium tuberculosis complex lineage 5 exhibits high levels of within-lineage genomic diversity and differing gene content compared to the type strain H37Rv. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: C. N’Dira Sanoussi; C. N’Dira Sanoussi; Mireia Coscolla; Boatema Ofori-Anyinam; Isaac Darko Otchere; Martin Antonio; Stefan Niemann; Julian Parkhill; Julian Parkhill; Simon R. Harris; Dorothy Yeboah-Manu; Sebastien Gagneux; Sebastien Gagneux; Leen Rigouts; Leen Rigouts; Dissou Affolabi; Bouke C. de Jong; Conor J. Meehan; Conor J. Meehan
Opublikowane w: Microbial Genomics, Numer 2, 2021, ISSN 2057-5858
Wydawca: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mgen.0.000437

Clinical and bacterial determinants of unfavorable tuberculosis treatment outcomes: an observational study in Georgia (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Galo A. Goig, Chloé Loiseau, Nino Maghradze, Kakha Mchedlishvili, Teona Avaliani, Ana Tsutsunava, Daniela Brites, Sevda Kalkan, Sonia Borrell, Rusudan Aspindzelashvili, Zaza Avaliani, Maia Kipiani, Nestani Tukvadze, Levan Jugheli, Sebastien Gagneux
Opublikowane w: Genome Medicine, Numer 17, 2025, ISSN 1756-994X
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13073-025-01555-0

HIV co-infection is associated with reduced<i>Mycobacterium tuberculosis</i>transmissibility in sub-Saharan Africa (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Etthel M. Windels, Eddie M. Wampande, Moses L. Joloba, W. Henry Boom, Galo A. Goig, Helen Cox, Jerry Hella, Sonia Borrell, Sebastien Gagneux, Daniela Brites, Tanja Stadler
Opublikowane w: PLoS Pathogens, 2023, ISSN 1553-7374
Wydawca: PLOS
DOI: 10.1101/2023.09.12.557301

Developing customized stepwise MIRU-VNTR typing for tuberculosis surveillance in Georgia (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Nino Maghradze; Levan Jugheli; Sonia Borrell; Nestani Tukvadze; Russell R. Kempker; Henry M. Blumberg; Sebastien Gagneux
Opublikowane w: PLoS One, Numer 1, 2022, ISSN 1932-6203
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.5451/unibas-ep90637

Local adaptation in populations of Mycobacterium tuberculosis endemic to the Indian Ocean Rim (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Fabrizio Menardo; Fabrizio Menardo; Liliana K. Rutaihwa; Liliana K. Rutaihwa; Michaela Zwyer; Michaela Zwyer; Sonia Borrell; Sonia Borrell; Iñaki Comas; Emilyn Costa Conceição; Emilyn Costa Conceição; Mireia Coscolla; Helen Cox; Moses Joloba; Horng-Yunn Dou; Julia Feldmann; Julia Feldmann; Lukas Fenner; Lukas Fenner; Lukas Fenner; Janet A. M. Fyfe; Qian Gao; Darío García de Viedma; Alberto
Opublikowane w: F1000Research, Numer 1, 2021, ISSN 2046-1402
Wydawca: F1000 Research Ltd.
DOI: 10.12688/f1000research.28318.2

Mortality from drug-resistant tuberculosis in high-burden countries comparing routine drug susceptibility testing with whole-genome sequencing: a multicentre cohort study (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Zürcher K, Reichmuth ML, Ballif M, Loiseau C, Borrell S, Reinhard M, Skrivankova V, Hömke R, Sander P, Avihingsanon A, Abimiku AG, Marcy O, Collantes J, Carter EJ, Wilkinson RJ, Cox H, Yotebieng M, Huebner R, Fenner L, Böttger EC, Gagneux S, Egger M.
Opublikowane w: Lancet Microbe, 2021, ISSN 0140-6736
Wydawca: The Lancet Publishing Group
DOI: 10.1016/s2666-5247(21)00044-6

A new nomenclature for the livestock-associated Mycobacterium tuberculosis complex based on phylogenomics (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Michaela Zwyer; Cengiz Çavusoglu; Giovanni Ghielmetti; Maria Lodovica Pacciarini; Erika Scaltriti; Dick Van Soolingen; Anna Dötsch; Miriam Reinhard; Sebastien Gagneux; Daniela Brites
Opublikowane w: Open Research Europe, Numer 1, 2021, ISSN 2732-5121
Wydawca: European Commission
DOI: 10.12688/openreseurope.14029.2

Variability in intrinsic drug tolerance in <i>Mycobacterium tuberculosis</i> corresponds with phylogenetic lineage (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Valerie F. A. March, Michaela Zwyer, Chloé Loiseau, Daniela Brites, Galo A. Goig, Selim Bouaouina, Anna Doetsch, Miriam Reinhard, Sevda Kalkan, Sebastien Gagneux, Sonia Borrell
Opublikowane w: Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Numer 69, 2025, ISSN 0066-4804
Wydawca: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aac.00996-25

The within-host evolution of antimicrobial resistance in Mycobacterium tuberculosis. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Rhastin A D Castro; Rhastin A D Castro; Sonia Borrell; Sonia Borrell; Sebastien Gagneux; Sebastien Gagneux
Opublikowane w: FEMS Microbiology Reviews, Numer 6, 2021, ISSN 0168-6445
Wydawca: Blackwell
DOI: 10.1093/femsre/fuaa071

Using population-specific add-on polymorphisms to improve genotype imputation in underrepresented populations (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Zhi Ming Xu; Sina Rüeger; Michaela Zwyer; Daniela Brites; Hellen Hiza; Miriam Reinhard; Liliana Rutaihwa; Sonia Borrell; Faima Isihaka; Hosiana Temba; Thomas Maroa; Rastard Naftari; Jerry Hella; Mohamed Sasamalo; Klaus Reither; Damien Portevin; Sebastien Gagneux; Jacques Fellay
Opublikowane w: PLoS Computational Biology, Numer 1, 2022, Strona(/y) e1009628, ISSN 1553-734X
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1009628

Gene conversion and duplication contribute to genetic variation in an outbreak of Mycobacterium tuberculosis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Christoph Stritt, Michelle Reitsma, Ana Maria Garcia Marin, Galo Goig, Anna Dötsch, Sonia Borrell, Christian Beisel, Iñaki Comas, Daniela Brites, Sebastien Gagneux
Opublikowane w: Microbial Genomics, Numer 11, 2025, ISSN 2057-5858
Wydawca: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mgen.0.001396

Drug-induced differential culturability in diverse strains of Mycobacterium tuberculosis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Valerie F. A. March, Nino Maghradze, Kakha Mchedlishvili, Teona Avaliani, Rusudan Aspindzelashvili, Zaza Avaliani, Maia Kipiani, Nestani Tukvadze, Levan Jugheli, Selim Bouaouina, Anna Doetsch, Galo A. Goig, Sebastien Gagneux, Sonia Borrell
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 15, 2025, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-85092-7

Onset of infectiousness explains differences in transmissibility across Mycobacterium tuberculosis lineages (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Etthel M. Windels, Cecilia Valenzuela Agüí, Bouke C. de Jong, Conor J. Meehan, Chloé Loiseau, Galo A. Goig, Michaela Zwyer, Sonia Borrell, Daniela Brites, Sebastien Gagneux, Tanja Stadler
Opublikowane w: Epidemics, Numer 51, 2025, Strona(/y) 100821, ISSN 1755-4365
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.epidem.2025.100821

The relative transmission fitness of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis in a drug resistance hotspot (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Chloé Loiseau, Etthel M. Windels, Sebastian M. Gygli, Levan Jugheli, Nino Maghradze, Daniela Brites, Amanda Ross, Galo Goig, Miriam Reinhard, Sonia Borrell, Andrej Trauner, Anna Dötsch, Rusudan Aspindzelashvili, Rebecca Denes, Klaus Reither, Christian Beisel, Nestani Tukvadze, Zaza Avaliani, Tanja Stadler, Sebastien Gagneux
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 14, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-37719-y

Transmission as a Key Driver of Resistance to the New Tuberculosis Drugs (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Galo A. Goig, Chloé Loiseau, Nino Maghradze, Kakha Mchedlishvili, Teona Avaliani, Daniela Brites, Sonia Borrell, Rusudan Aspindzelashvili, Zaza Avaliani, Maia Kipiani, Nestani Tukvadze, Levan Jugheli, Sebastien Gagneux
Opublikowane w: New England Journal of Medicine, Numer 392, 2025, Strona(/y) 97-99, ISSN 0028-4793
Wydawca: Massachusetts Medical Society
DOI: 10.1056/nejmc2404644

Within-host evolution of drug tolerance in <i>Mycobacterium tuberculosis</i> (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Valerie F A March, Kakha Mchedlishvili, Galo A Goig, Nino Maghradze, Teona Avaliani, Rusudan Aspindzelashvili, Zaza Avaliani, Maia Kipiani, Nestani Tukvadze, Levan Jugheli, Selim Bouaouina, Anna Doetsch, Sevda Kalkan, Miriam Reinhard, Sebastien Gagneux, Sonia Borrell
Opublikowane w: JAC-Antimicrobial Resistance, Numer 8, 2026, ISSN 2632-1823
Wydawca: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/jacamr/dlag007

Linking genetic and phenotypic bedaquiline resistance in Mycobacterium tuberculosis strains from Georgia (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Nino Maghradze, Chloé Loiseau, Galo Adrian Goig, Nino Bablishvili, Levan Jugheli, Sonia Borrell, Nestani Tukvadze, Russell Ryan Kempker, Zaza Avaliani, Sebastien Gagneux
Opublikowane w: PLOS One, Numer 20, 2025, Strona(/y) e0326794, ISSN 1932-6203
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0326794

Back-to-Africa introductions of Mycobacterium tuberculosis as the main cause of tuberculosis in Dar es Salaam, Tanzania (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Michaela Zwyer, Liliana K. Rutaihwa, Etthel Windels, Jerry Hella, Fabrizio Menardo, Mohamed Sasamalo, Gregor Sommer, Lena Schmülling, Sonia Borrell, Miriam Reinhard, Anna Dötsch, Hellen Hiza, Christoph Stritt, George Sikalengo, Lukas Fenner, Bouke C. De Jong, Midori Kato-Maeda, Levan Jugheli, Joel D. Ernst, Stefan Niemann, Leila Jeljeli, Marie Ballif, Matthias Egger, Niaina Rakotosamimanana, Dor
Opublikowane w: PLOS Pathogens, Numer 19, 2023, Strona(/y) e1010893, ISSN 1553-7374
Wydawca: PLOS
DOI: 10.1371/journal.ppat.1010893

Prisons as ecological drivers of fitness-compensated multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Gygli SM, Loiseau C, Jugheli L, Adamia N, Trauner A, Reinhard M, Ross A, Borrell S, Aspindzelashvili R, Maghradze N, Reither K, Beisel C, Tukvadze N, Avaliani Z, Gagneux S
Opublikowane w: Nature Medicine, 2021, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-021-01358-x

How do monomorphic bacteria evolve? The Mycobacterium tuberculosis complex and the awkward population genetics of extreme clonality (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sebastien Gagneux, Christoph Stritt
Opublikowane w: Peer Community In Evolutionary Biology, 2022, ISSN 2551-668X
Wydawca: Peer Community In Evolutionary Biology
DOI: 10.32942/x2gw2p

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Podczas wyszukiwania danych OpenAIRE wystąpił błąd

Brak wyników

Moja broszura 0 0