Innvative approaches to identification of metabolic Targets for antimicrobials

Informacje na temat projektu

INNOTARGETS

Identyfikator umowy o grant: 956154

DOI

10.3030/956154

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 13 Sierpnia 2020

Data rozpoczęcia 1 Marca 2021

Data zakończenia 30 Listopada 2025

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Koszt całkowity

€ 3 260 954,70

Wkład UE

€ 3 260 954,70

Koordynowany przez

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Documents, reports (1)

At least 6 outreach and dissemination events (as per Table 2.3a and 2.4)

At least 6 outreach and dissemination events as per Table 23a and 24 have been completed

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

INNOTARGETS website and other social media online

INNOTARGETS website and other social media is online

Publikacje

Peer reviewed articles (16)

Optimizing phage-based mutant recovery and minimizing heat effect in the construction of transposon libraries in Staphylococcus aureus

Autorzy: Sally W. Yousief, Nader Abdelmalek, Bianca Paglietti
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 14, 2024, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-73731-y

Chromosomal genes modulating fosfomycin susceptibility in uropathogenic <i>Escherichia coli</i> : a genome-wide analysis

Autorzy: Yibing Ma, Mattia Pirolo, Lily Giarratana, Karen Leth Nielsen, Susanne Häussler, Luca Guardabassi
Opublikowane w: Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Numer 69, 2025, ISSN 0066-4804
Wydawca: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aac.01417-24

Algebraic differentiation for fast sensitivity analysis of optimal flux modes in metabolic models

Autorzy: Hester Chapman, Miroslav Kratochvíl, Oliver Ebenhöh, St Elmo Wilken
Opublikowane w: Bioinformatics, Numer 41, 2025, ISSN 1367-4811
Wydawca: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/bioinformatics/btaf287

The Secondary Resistome of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus to β-Lactam Antibiotics

Autorzy: Nader Abdelmalek, Sally Waheed Yousief, Martin Saxtorph Bojer, Mosaed Saleh A. Alobaidallah, John Elmerdahl Olsen, Bianca Paglietti
Opublikowane w: Antibiotics, Numer 14, 2025, Strona(/y) 112, ISSN 2079-6382
Wydawca: MDPI AG
DOI: 10.3390/antibiotics14020112

Exploring the susceptome of methicillin-resistant Staphylococcus aureus to oxacillin and cefazolin using integrated transposon-directed insertion site sequencing and proteomics

Autorzy: Nader Abdelmalek, Sally W. Yousief, Alessandro Tanca, Martin S. Bojer, Mosaed Saleh A. Alobaidallah, John E. Olsen, Bianca Paglietti
Opublikowane w: International Journal of Antimicrobial Agents, Numer 66, 2025, Strona(/y) 107652, ISSN 0924-8579
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ijantimicag.2025.107652

A Novel Algorithm to Calculate Elementary Modes: Analysis of<i>Campylobacter jejuni</i>Metabolism

Autorzy: Yanica Said, Dipali Singh, Cristiana Sebu, Mark Poolman
Opublikowane w: Biosystems, 2023, ISSN 1872-8324
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.01.11.521685

Early prediction of potential hepatotoxic metabolites to aid lead selection in drug discovery

Autorzy: Linda Chiappalupi, Domingo Gargallo-Viola, Antoni Torrens
Opublikowane w: Open Research Europe, Numer 5, 2025, Strona(/y) 307, ISSN 2732-5121
Wydawca: F1000 Research Ltd
DOI: 10.12688/openreseurope.21392.1

Genome-wide identification of tissue-specific fitness genes in murine models of Staphylococcus aureus infection

Autorzy: Sally W. Yousief, Nader Abdelmalek, Martin S. Bojer, Yibing Ma, Priscila R. Guerra, Sajid Nisar, John E. Olsen, Bianca Paglietti
Opublikowane w: iScience, Numer 29, 2025, Strona(/y) 114261, ISSN 2589-0042
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.isci.2025.114261

Deletion of pcnB affects antibiotic susceptibility in resistant Escherichia coli by reducing copy number of ColE1-family plasmids

Autorzy: Sandra Marina Wellner, Xiao Fei, Ana Herrero-Fresno, John Elmerdahl Olsen
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 15, 2025, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-025-92308-x

The intrinsic macrolide resistome of <i>Escherichia coli</i>

Autorzy: Yibing Ma, Mattia Pirolo, Bimal Jana, Viktor Hundtofte Mebus, Luca Guardabassi
Opublikowane w: Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Numer 68, 2024, ISSN 0066-4804
Wydawca: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aac.00452-24

Screening Actinomycetes extracts for antimicrobial compounds against methicillin-resistant Staphylococcus aureus and helper-compounds against aminoglycoside-resistant E. coli

Autorzy: Dina Al Nahhas, Sandra Marina Wellner, Margherita Sosio, Sonia I Maffioli, Salvatore Pisanu, Sergio Uzzau, Daniela Pagnozzi, Stefano Donadio, John Elmerdahl Olsen
Opublikowane w: Open Research Europe, Numer 5, 2025, Strona(/y) 110, ISSN 2732-5121
Wydawca: F1000 Research Ltd
DOI: 10.12688/openreseurope.19988.1

Comparative proteomics analysis of MRSA under different experimental conditions

Autorzy: Dina Al Nahhas, Salvatore Pisanu, Alessandro Tanca, Bianca Paglietti, Antonella Santona, Sergio Uzzau, Daniela Pagnozzi
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 15, 2025, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-025-04224-9

A novel high-throughput screening method for identifying compounds that inhibit plasmid conjugation

Autorzy: Jennifer Moussa, Domingo Gargallo-Viola, Line Elnif Thomsen
Opublikowane w: MethodsX, Numer 12, 2025, Strona(/y) 102740, ISSN 2215-0161
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.mex.2024.102740

Genome-wide identification of fitness-genes in aminoglycoside-resistant Escherichia coli during antibiotic stress

Autorzy: Sandra Marina Wellner, Mosaed Saleh A. Alobaidallah, Xiao Fei, Ana Herrero-Fresno, John Elmerdahl Olsen
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 14, 2024, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-54169-8

Macrolide Resistance and In Vitro Potentiation by Peptidomimetics in Porcine Clinical Escherichia coli

Autorzy: Yibing Ma, Mattia Pirolo https://orcid.org/0000-0002-9814-1500 Prabha Subramani, Ronette Gehring, Peter Damborg https://orcid.org/0000-0001-9932-5996 Henrik Franzyk https://orcid.org/0000-0002-2822-1927 Luca Guardabassi https://orcid.org/0000-0002-2389-5084
Opublikowane w: mSphere, Numer vol 7 number 5, 2023, ISSN 2379-5042
Wydawca: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/msphere.00402-22

Genome-wide Identification of conditionally essential genes supporting <i>Streptococcus suis</i> growth in serum and cerebrospinal fluid

Autorzy: Maria Juanpere-Borras, Tiantong Zhao, Jos Boekhorst, Blanca Fernandez-Ciruelos, Rajrita Sanyal, Nissa Arifa, Troy Wagenaar, Peter van Baarlen, Jerry M. Wells
Opublikowane w: Virulence, Numer 17, 2025, ISSN 2150-5594
Wydawca: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/21505594.2025.2600145