Leczenie stanów zapalnych
Stan zapalny jest próbą ochrony organizmu przed skutkami działania uszkodzonych komórek, substancji drażniących i patogenów. Produkcja cząsteczek wymaganych w reakcjach zapalnych jest ściśle regulowana. DNA koduje białka przy wykorzystaniu RNA jako planu do transmisji każdego z kodów do cytoplazmy, w której są one formowane. Sugeruje to, że kontrola stanu zapalnego może odbywać się za pomocą RNA. Białka, które przyłączają się do RNA - białka wiążące RNA, mogą regulować stan zapalny poprzez formowanie kompleksów białkowych. Ludzki antygen R białek wiążących RNA jest istotnym modulatorem funkcji informacyjnego RNA. Ludzki antygen R jest ważnym dla czynności komórek białkiem, znajduje się on w cytoplazmie, gdzie stabilizuje wiele informacyjnych RNA. W ramach finansowanego przez UE projektu "Nuclear HuR-hnRNP interactions in post-transcriptional regulation of inflammatory gene expression" (NRNPS & INFLAMMATION) badano rolę heterogenicznych kompleksów jądrowych rybonukleoprotein. Poprzednie badania przeprowadzone przez jednego z partnerów projektu pokazały, że nadmiernie ekspresjonowane ludzkie antygeny R znajdujące się w jądrze, powodują represję translacji informacyjnych RNA oraz łagodzą silne reakcje zapalne. Będąc w jądrze, pomagają one regulować ekspresję genów po transkrypcji poprzez interakcje z kompleksami heterogenicznych jądrowych rybonukleoprotein. Po raz pierwszy w świecie nauki badacze opracowali podejście w oparciu o cały genom. Metody PAR-CLIP (photoactivatable-ribonucleoside-enhanced crosslinking and immunoprecipitation) pozwalają na identyfikację powiązanych RNA oraz określenie umiejscowienia wiązań białkowych w RNA. Przy wykorzystaniu metody PAR-CLIP naukowcom udało się zidentyfikować zmieniające się podczas stanu zapalnego cele RNA ludzkich antygenów R. Ponadto, sposoby zachowania antygenów R heterogenicznych jądrowych rybonukleoprotein w różnych miejscach informacyjnych RNA wyjaśniły do pewnego stopnia mechanizmy reakcji odpornościowych. Zidentyfikowano też odchylenia informacyjnych RNA związane z niedostatkiem ludzkich antygenów R podczas chorób, takich jak nieswoiste zapalenie jelit i rak jelit. Eksperymenty z wykorzystaniem "knock-downu" genowego wykazały, że niektóre interakcje ludzkiego antygenu R sprzyjają zapaleniom, natomiast inne dają efekty immunoregulacyjne. Oczekuje się, że metody PAR-CLIP mogą być wykorzystane do analiz zmodyfikowanych systemów transgenicznych oraz oceny ich funkcji. Określenie nowych sposobów regulacji i kontroli przewlekłych dysfunkcji zapalnych może otworzyć drogę do nowatorskich sposobów leczenia reumatoidalnego zapalenia stawów, wielu typów raka, kataru siennego i miażdżycy. Technologie opracowane w ramach projektu NRNPS & INFLAMMATION mogą też być wykorzystane do monitorowania chorób.
