Nowoczesne próbniki do badania sygnalizacji wewnątrzkomórkowej
Receptor trifosforanu inozytolu (IP3) jest białkiem błony komórkowej, znajdującym się w retikulum endoplazmatycznym komórki. Jest aktywowany przez przekaźnik wewnątrzkomórkowy, jakim jest związek trifosforan inozytolu i działa jako kanał wapniowy. Jego rola polega na kontrolowaniu różnych procesów komórkowych i fizjologicznych, w tym podziału komórki, proliferacji i apoptozy. Finansowany ze środków UE projekt SELECTIPROBE obrał sobie za cel opracowanie nowych ligand to zbadania roli różnych receptorów IP3 w procesie wewnatrzkomórkowej sygnalizacji wapniowej. Takie selektywne ligandy byłyby przydatne w definiowaniu szczególnej roli, jaką każdy z podtypów receptora IP3 odgrywa w funkcji komórkowej i chorobach, takich jak arytmia i przerost mięśnia sercowego. Ponadto, celem konsorcjum było wyprodukowanie selektywnych i silnych antagonistów nie-inozytolowych receptora IP3, których zadaniem byłoby blokowanie aktywności receptora IP3 w momencie wystąpienia zaburzenia funkcji. W tym celu naukowcy przeprowadzili badania przesiewowe in silico i dzięki zaawansowanej technologii zidentyfikowali obiecujące związki. Zostały one następnie poddane badaniom przesiewowym przy użyciu spektroskopii STD NMR pod kątem tworzenia wiązań z białkami w miejscach wiązań białek i fosforanów. Aktywność związków została bardziej szczegółowo określona przy użyciu różnych testów komórkowych. Naukowcy dokonali syntezy tiazolidyny i zidentyfikowali interakcje wiązania z galaktozylem — albuminą ludzkiego osocza. Wykonali również badania krystalografii rentgenowskiej, aby poznać strukturę 3D trzech związków tiazolidonu i wybrali grupę cząsteczek o domniemanym działaniu hamującym. Te wnioski zainspirowały dalsze doświadczenia w modelowaniu, których celem ma być opracowanie nowych struktur oraz uzyskanie najbardziej skutecznych inhibitorów. Oczekuje się, że prace te pomogą w zrozumieniu roli różnych receptorów IP3 w procesach zdrowotnych i chorobowych.
