Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
CORDIScovery podcast 50th episode CORDIScovery podcast 50th episode

Strengthening Computational Biodiversity Research in Greece

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Websites, patent fillings, videos etc. (1)
Separate Project/BCG website (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Set up of initial separate web page for BCG and the project completed.

Publikacje

Peer reviewed articles (23)
Cryptic diversity and phylogeographic patterns of Mediodactylus species in the Eastern Mediterranean region (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Panayiota Kotsakiozi, Aglaia Antoniou, Nikolaos Psonis, Κostas Sagonas, Emmanouela Karameta, Çetin Ilgaz, Yusuf Kumlutaş, Aziz Avcı, Daniel Jablonski, Diego Darriba, Alexandros Stamatakis, Petros Lymberakis, Nikos Poulakakis
Opublikowane w: Molecular Phylogenetics and Evolution, Numer 197:108091, 2024, ISSN 1095-9513
Wydawca: Elsevier science
DOI: 10.1016/j.ympev.2024.108091

Accelerating Maximum Likelihood Phylogenetic Inference via Early Stopping to Evade (Over-)optimization (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Anastasis Togkousidis; Alexandros Stamatakis; Olivier Gascuel
Opublikowane w: Systematic Biology, 2025, ISSN 2692-8205
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.1093/SYSBIO/SYAF043

raxtax: a k-mer-based non-Bayesian taxonomic classifier (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Noah A Wahl , Georgios Koutsovoulos , Ben Bettisworth , Alexandros Stamatakis
Opublikowane w: Bioinformatics,, Numer 41, 12, 2025, ISSN 1367-4811
Wydawca: Oxford academic
DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAF620

Complexity of avian evolution revealed by family-level genomes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Josefin Stiller, Shaohong Feng, Al-Aabid Chowdhury, Iker Rivas-González, David A. Duchêne, Qi Fang, Yuan Deng, Alexey Kozlov, Alexandros Stamatakis, Santiago Claramunt, Jacqueline M. T. Nguyen, Simon Y. W. Ho, Brant C. Faircloth, Julia Haag, Peter Houde,
Opublikowane w: Nature, 2024, ISSN 1476-4687
Wydawca: Springer nature
DOI: 10.1038/s41586-024-07323-1

Unravelling the thread of Podarcis omics; insights into the genome and transcriptome of the Cretan wall lizard (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Manos Stratakis, Panagiotis Ioannidis, Iliana Bista, Dominic Absolon, Will Eagles, Shane McCarthy, Amy Denton, Petros Lymberakis, Nikos Poulakakis
Opublikowane w: Genes & Genomics, Numer 48, 2026, ISSN 1976-9571
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/S13258-025-01676-1

Phylogenetic reconciliation: making the most of genomes to understand microbial ecology and evolution (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Williams, Tom A.; Davin, Adrian A.; Szánthó, Lénárd L.; Stamatakis, Alexandros; Wahl, Noah A.; Woodcroft, Ben J.; Soo, Rochelle M.; Eme, Laura; Sheridan, Paul O.; Gubry-Rangin, Cecile; Spang, Anja; Hugenholtz, Philip; Szöllősi, Gergely J.
Opublikowane w: The ISME Journal, 2024, ISSN 1751-7370
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.5445/IR/1000173538

Memoization on Shared Subtrees Accelerates Computations on Genealogical Forests (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Lukas Hübner; Alexandros Stamatakis
Opublikowane w: ISSN: 1868-8969, 2024, ISSN 1868-8969
Wydawca: Dagstuhl Publishing
DOI: 10.5445/IR/1000174546/PRE

Identification of the 18 World War II executed citizens of Adele, Rethymnon, Crete using an ancient DNA approach and low coverage genomes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Nikolaos Psonis, Despoina Vassou, Argyro Nafplioti, Eugenia Tabakaki, Pavlos Pavlidis, Alexandros Stamatakis, Nikos Poulakakis
Opublikowane w: Forensic Science International: Genetics, Numer 71, 2024, ISSN 1872-4973
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.FSIGEN.2024.103060

Performance assessment of phylogenetic inference tools using PhyloSmew (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Dimitri Höhler, Julia Haag, Alexey M Kozlov, Benoit Morel, Alexandros Stamatakis
Opublikowane w: Bioinformatics Advances, Numer 5, 2025, ISSN 2635-0041
Wydawca: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/BIOADV/VBAF300

The Free Lunch is not over yet – Systematic Exploration of Numerical Thresholds in Phylogenetic Inference (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Julia Haag; Lukas Hübner; Alexey M. Kozlov; Alexandros Stamatakis
Opublikowane w: Bioinformatics Advances, 2022, ISSN 2635-0041
Wydawca: Oxford Academics
DOI: 10.1101/2022.07.13.499893

Adaptive RAxML-NG: Accelerating Phylogenetic Inference under Maximum Likelihood using Dataset Difficulty (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Anastasis Togkousidis, Oleksiy M Kozlov, Julia Haag, Dimitri Höhler, Alexandros Stamatakis
Opublikowane w: Molecular Biology and Evolution, Numer Volume 40, Numer 10, 2023, ISSN 1537-1719
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.1093/molbev/msad227

Comparative Genomics Uncovers the Evolutionary Dynamics of Detoxification and Insecticide Target Genes Across 11 Phlebotomine Sand Flies (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jason Charamis, Sofia Balaska, Panagiotis Ioannidis, Vít Dvořák, Konstantinos Mavridis, Mary Ann McDowell, Pavlos Pavlidis, René Feyereisen, Petr Volf, John Vontas
Opublikowane w: Genome Biology and Evolution, Numer 16, 2024, ISSN 1759-6653
Wydawca: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/GBE/EVAE186

Parameter Estimation and Species Tree Rooting Using ALE and GeneRax (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Tom A Williams; Adrián A Davín; Benoit Morel; Lénárd L Szánthó; Anja Spang; Alexandros Stamatakis; Philip Hugenholtz; Gergely J Szöllősi
Opublikowane w: Genome Biology and Evolution, 2023, ISSN 1759-6653
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.5445/ir/1000161500

Simulations of Sequence Evolution: How (Un)realistic They Are and Why (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Johanna Trost, Julia Haag, Dimitri Höhler, Laurent Jacob, Alexandros Stamatakis, Bastien Boussau Author Notes
Opublikowane w: Molecular Biology and Evolution,, Numer Volume 41, Numer 1, 2024, ISSN 1537-1719
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.1093/molbev/msad277

Read Length Dominates Phylogenetic Placement Accuracy of Ancient DNA Reads (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ben Bettisworth; Nikolaos Psonis; Nikos Poulakakis; Pavlos Pavlidis; Alexandros Stamatakis
Opublikowane w: Molecular Biology and Evolution, 2025, ISSN 1537-1719
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.1093/MOLBEV/MSAF006

Forensic Science International: Genetics (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Psonis, Nikolaos and Vassou, Despoina and Nafplioti, Argyro and Tabakaki, Eugenia and Pavlidis, Pavlos and Stamatakis, Alexandros and Poulakakis, Nikos,
Opublikowane w: Forensic Science International: Genetics, 2024, ISSN 1872-4973
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.FSIGEN.2024.10306

A systematic exploration of current limitations of cognate-based phylogenetic inference (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Häuser, Luise; Jäger, Gerhard; Stamatakis, Alexandros
Opublikowane w: Open Research Europe, 2025, ISSN 2732-5121
Wydawca: Open Research Europe
DOI: 10.12688/OPENRESEUROPE.20351.3

Necessary reforms in the Greek academic system (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Alexandros Stamatakis; Alexandros Stamatakis; Alexandros Stamatakis; Panagiotis Tsakalides; Panagiotis Tsakalides; Melina Tamiolaki; Melina Tamiolaki; Melina Tamiolaki
Opublikowane w: Frontiers in Political Science, 2024, ISSN 2673-3145
Wydawca: frontiers
DOI: 10.5445/IR/1000177163

Phylourny: efficiently calculating elimination tournament win probabilities via phylogenetic methods (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ben Bettisworth, Alexander I. Jordan & Alexandros Stamatakis
Opublikowane w: Statistics and Computing, 2023, ISSN 0960-3174
Wydawca: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s11222-023-10246-y

AleRax: a tool for gene and species tree co-estimation and reconciliation under a probabilistic model of gene duplication, transfer, and loss (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Benoit Morel, Tom A Williams, Alexandros Stamatakis, Gergely J Szöllősi
Opublikowane w: Bioinformatics, Numer Volume 40, Numer 4, 2024, ISSN 1367-4811
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.1093/bioinformatics/btae162

Advances and challenges in understanding evolution through genome comparison: meeting report of the European Molecular Biology Organization (EMBO) lecture course “Evolutionary and Comparative Genomics” (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Athina Gavriilidou, Alexandros Stamatakis, Anne Kupczok, Iliana Bista, Chris D Jiggins, Rosa Fernández, Eirini Skourtanioti, Grigoris Amoutzias, Daniela Delneri, Nikos Kyrpides, Christoforos Nikolaou, Alexandros A Pittis, Tereza Manousaki, Nikolaos Vakirlis
Opublikowane w: Bioinformatics Advances, Numer 5, 2025, ISSN 2635-0041
Wydawca: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/BIOADV/VBAF223

The power and limitations of species tree-aware phylogenetics (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Tom A. Williams, Adrian A. Davin, Benoit Morel, Lenard L. Szantho, Anja Spang, Alexandros Stamatakis, Philip Hugenholtz, Gergely J. Szollosi
Opublikowane w: Evolutionary Biology, 2023, ISSN 2692-8205
Wydawca: biorXiv
DOI: 10.1101/2023.03.17.533068

Pandora: A Tool to Estimate Dimensionality Reduction Stability of Genotype Data (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Julia Haag; Alexander I. Jordan; Alexandros Stamatakis
Opublikowane w: Bioinformatics Advances, 2025, ISSN 2635-0041
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.1093/BIOADV/VBAF040

Conference proceedings (3)
Parallel Inference of Phylogenetic Stands with Gentrius (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Anastasis Togkousidis; Olga Chernomor; Alexandros Stamatakis
Opublikowane w: 2023 IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium Workshops (IPDPSW), 2023, ISBN 979-8-3503-1199-0
Wydawca: IEEEXplore
DOI: 10.1109/IPDPSW59300.2023.00035

Are Sounds Sound for Phylogenetic Reconstruction?

Autorzy: Luise Häuser, Gerhard Jäger, Taraka Rama, Johann-Mattis List, Alexandros Stamatakis
Opublikowane w: -, 2024, ISSN 2331-8422
Wydawca: Arxiv

EcoFreq: Compute with Cheaper, Cleaner Energy via Carbon-aware Power Scaling (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Alexey Kozlov, Alexandros Stamatakis
Opublikowane w: ISC High Performance 2024 Research Paper Proceedings, Numer pp. 1-12, 2024, ISBN 978-3-9826336-0-2
Wydawca: Prometeus GmbH
DOI: 10.23919/ISC.2024.10528928.

Other (3)
bigrig: A range simulator for the DEC[+J] model (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ben Bettisworth, Alexis Stamatakis
Opublikowane w: biorvix preprint, 2025, ISSN 2692-8205
Wydawca: biorvix
DOI: 10.1101/2025.11.24.690345

Pandora: A Tool to Estimate Dimensionality Reduction Stability of Genotype Data

Autorzy: Julia Haag, Alexander I. Jordan, Alexandros Stamatakis
Opublikowane w: biorXiv preprint, 2024, ISSN 2692-8205
Wydawca: bioRxiv

Predicting Phylogenetic Bootstrap Values via Machine Learning

Autorzy: Julius Wiegert, Julia Haag, Dimitri Hoehler, Alexandros Stamatakis
Opublikowane w: bioRxiv preprint, 2024, ISSN 2692-8205
Wydawca: bioRxiv

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Podczas wyszukiwania danych OpenAIRE wystąpił błąd

Brak wyników

Udostępnij tę stronę Udostępnij tę stronę w mediach społecznościowych

Pobierz Pobierz zawartość strony

Ostatnia aktualizacja: 1 Września 2025

Moja broszura

Permalink: https://cordis.europa.eu/project/id/101087081/results/pl

European Union, 2026

Moja broszura 0 0