Wsparcie dla badań nad naturalnymi produktami prowadzonych we Włoszech
Proces projektowania leku został znacznie ułatwiony i udoskonalony za pomocą metod obliczeniowych wykorzystujących symulacje z zakresu mechaniki kwantowej. Jest to szczególnie przydatne w przypadku obliczania interakcji enzymów uczestniczących w reakcjach zachodzących za pośrednictwem metali. Grupa NeaNAT z siedzibą w Dipartimento di Chimica delle Sostanze Naturali, na Uniwersytecie Fryderyka II w Neapolu uczestniczy aktywnie w izolacji i identyfikacji produktów naturalnych pochodzenia morskiego. Najnowsze prace prowadzone przez grupę zostały rozszerzone na badanie biologicznej i farmakologicznej aktywności wyizolowanych związków oraz ich biosyntezy. W rezultacie zdolność do badania biogenetycznego szlaku produktów naturalnych jest kluczowa dla zachowania wiodącej pozycji NeaNAT w tej dziedzinie. Aby to osiągnąć, finansowany ze środków UE projekt NATPHARMA postawił sobie za cel wzmocnienie infrastruktury badawczej oraz potencjału ludzkiego grupy NeaNAT oraz rozwój jej powiązań z innymi instytucjami badawczymi. Inicjatywa NATPHARMA przyczyniła się do tego poprzez zakup spektrometru masowego o wysokiej rozdzielczości o nazwie Orbitrap, który znacząco zwiększy potencjał analityczny grupy NeaNAT. Ponadto grupa zakupiła potężny sprzęt w postaci superkomputera o olbrzymiej mocy obliczeniowej (HPC) oraz oprogramowanie dla infrastruktury obliczeniowej w celu rozwoju analizy obliczeniowej pozyskiwanych danych. Ponadto pozyskano naukowców dysponujących fachową wiedzą w zakresie genów biosyntezy i obliczeń z zakresu mechaniki kwantowej wykorzystywanych do badania interakcji potencjalnych leków. Spowodowało to poważne zwiększenie potencjału badawczego i poprawiło rozwój w zakresie nawiązywania kontaktów przez grupę NeaNAT poprzez wizyty wiodących naukowców z całej Europy. Pozyskano nowe techniki, takie jak analiza metodą końcowego polimorfizmu długości fragmentów restrykcyjnych (T-RFLP) i zrealizowano odpowiednie projekty. Na przykład opracowano nowe inhibitory FAAH i COX2 jako potencjalne środki znieczulające i zidentyfikowano analogi bioaktywnego metabolitu bakteryjnego o nazwie hormaomycyna. Aby rozpowszechnić informacje o swoich nowych kompetencjach wśród społeczności międzynarodowej i utworzyć nowe powiązania ze środowiskami akademickimi i przedsiębiorstwami, grupa NeaNAT zorganizowała międzynarodowe spotkanie pod tytułem "NatPharma: odkrycie leku wspierane przez naturę (NADD)". Zjazd przyciągnął ponad 140 uczestników z 9 krajów Europy i zaowocował bardzo pozytywną informacją zwrotną. Podsumowując, działania projektu NATPHARMA ukierunkowane były nie tylko na rozwój naukowej wiedzy oraz potencjału grupy NeaNAT, ale również doprowadziły do udanej realizacji kompletnego planu opracowania leku na bazie źródeł naturalnych.